综合运用分类、聚类、RNA二级结构预测和序列模式分析等方法,来探索人类基因组及各种模式生物基因组序列中的非编码RNA基因的识别问题,研究内容包括非编码RNA基因的一级结构与二级结构的信息融合,非编码RNA基因家簇的特征表示及其新成员的识别,非编码RNA基因的通用分析方法,非编码RNA基因的分类和非编码RNA基因在基因组上的分布规律,并对若干新发现的非编码RNA基因进行实验验证。这一研究不但为非编码
无论是原核生物,还是真核生物,其基因组中均存在具有重要调控功能的非编码RNA(ncRNA),目前,ncRNA的识别与功能研究已成为功能基因组学研究的重要热点之一,为此,我们在此课题的资助下,重点开展了下列研究①酵母基因组中ncRNA的特征及预测研究;②人miRNA的特征及预测研究;③拟南芥基因组中miRNA预测研究;④基于小麦EST数据库的miRNA预测研究;⑤piRNA转录分析; ⑥建立了真核生物批量小RNA注释平台BatchGenAnno;⑦细菌基因组中小RNA的通用预测方法研究。通过这些研究,为ncRNA基因的实验发现与功能研究提供了支持与帮助。