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海带ROCO和NB-ARC类抗病基因的克隆和表达特征研究
  • 项目名称:海带ROCO和NB-ARC类抗病基因的克隆和表达特征研究
  • 项目类别:青年科学基金项目
  • 批准号:41206146
  • 申请代码:D0609
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2013-01-01-2015-12-31
  • 项目负责人:刘峰
  • 依托单位:中国科学院海洋研究所
  • 批准年度:2012
中文摘要:

大型褐藻模式物种长囊水云全基因组测序的完成和其先天免疫系统相关基因家族的挖掘,为海带抗病基因克隆提供了线索和依据,也为探索海带先天免疫系统的分子机制奠定了基础。本研究拟通过生物信息学技术分析长囊水云ROCO-LRR和NB-ARC-TPR类抗病基因家族的保守结构域及其它大型褐藻EST中具有相似结构的基因序列,设计兼并引物,依据同源序列法克隆海带基因组中ROCO和NB-ARC类基因的同源序列,并分析其结构特点和进化关系;通过RACE技术等分别克隆3条以上的ROCO-LRR类和NB-ARC-TPR类全长抗病基因,并通过定量RT-PCR和Western blot技术分析这些基因在海带幼孢子体和配子体感染细菌(褐藻酸降解菌)或卵菌前后的表达变化,探索ROCO和NB-ARC类基因在海带不同世代、感染不同病原微生物的表达特征。本项目有利于深入了解海带先天免疫防御系统的分子机制,为海带抗病育种提供理论基础

结论摘要:

英文主题词Saccharina japonica;resistance gene;brown alga;homologous sequence;express analysis


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