中文摘要：

研制鼠疫耶尔森氏菌全基因组DNA芯片（包含4000多条基因），针对若干代表菌株，进行比较基因组杂交，分析该4000多条基因在不同菌株间的差异分布。由芯片杂交结果可圈定进一步研究的靶标基因，然后扩大菌株范围进行大规模PCR扩增，可得到下述结果分析基因组岛在鼠疫菌和假结核菌间的差异分布，探究基因水平转移在鼠疫菌起源进化的作用。在染色体上鉴定若干差异区段（different region，DFR），根

结论摘要：

鼠疫耶尔森氏菌（以下简称鼠疫菌）是鼠疫的病原体，历史上曾引起三次世界鼠疫大流行。鼠疫菌是在1500-20000年前由假结核耶尔森氏菌进化而来的，作为一个新生的病原体，正处于进化的活跃时期。本研究成功研制了覆盖CO92、KIM、91001三株鼠疫菌序列的全基因组DNA芯片，以假结核耶尔森氏菌为参照，针对大量背景清楚的鼠疫菌菌株，进行了比较和进化基因组学研究，从基因获得和缺失的角度，较深入地认识了鼠疫菌的起源进化，建立了鼠疫菌基因组分型的策略和方法，据此进行了系统发育分析，认识鼠疫菌基因组微进化的基本规律，认识基因组微进化与鼠疫菌生态位适应和毒力分化之间的关系，认识各型别菌株栖息于特定生态位中的机理，认识鼠疫菌在中国传播和演化的规律，建立中国鼠疫菌遗传多态性文库，从基因组进化的角度探究了鼠疫菌演化与生态位适应的关系，在鼠疫爆发流行和生物恐怖事件中，可用于病原菌的来源追踪分析，为鼠疫防治工作提供了新思路。