以copia类反转录转座子的保守序列合成引物扩增水稻DNA,获22个反转录转座子克隆。它们的序列有很大差异,在不同品种中的分布也不同,提示反转录转座子序列的高度异质性和分布的多型性可能是造成水稻种质多样性的一个重要原因。检测这些克隆在水稻基因组中的分布,发现(1)反转录转座子主要集中分布于每条染色体的一条臂上;(2)着丝粒区有反转录转座子的分布;(3)一个反转录转座子可检测到多个位点,通常分布于不同染色体的相同部位。不同染色体上反转录转座子分布的相似性,提示水稻的12条染色体可能来源于一条或几条原始染色体,通过原始染色体的复制和基因的演变形成水稻基因组。而不活跃的反转录转座子作为进化的遗迹,可用于研究基因组的演变。