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共收集30份云南野生和逸生苜蓿资源，选育紫花苜蓿优良品种1个。研究结果表明云南野生和逸生苜蓿资源分布范围广，生境复杂，形态差异大，分为杂草地型、干热河谷型、丘陵山地型和其它类型；自然群落中优势植物和伴生植物共19科45种。德钦苜蓿在迪庆州德钦县自然状态下为优势种，呈连片分布，其它资源呈零星分布；资源分布地土壤含水量较低，土壤酸度差异较大，土壤比较贫瘠，表明这些资源生态幅较宽，有较强的适应性和竞争能力；ISSR分析其多态位点百分率为88.34%，表现为较高的遗传多样性；酸铝胁迫对苜蓿的生长有明显的抑制作用，多指标测定并用标准差权重法综合评价耐酸铝性效果较好，15、12、13和14表现出较强的耐酸铝性。干热胁迫下供试材料酶活性、电导率、脯氨酸、丙二醛含量呈逐步升高的趋势。丙二醛、相对电导率和水分饱和亏缺三个指标对干湿条件敏感，可用于苜蓿资源的耐干热性鉴定。HSPs的诱导、较高蛋白含量和较少蛋白降解的可作为紫花苜蓿耐热性评价的依据。以22、29号材料耐干热性最强。云南野生和逸生苜蓿资源形态分化大、随生境而易变的生理生化特性以及云南温和的气候可能是这些资源赖以保存和逸生的主要原因。