中文摘要：

岩原鲤是分布于长江上游及其支流的特有鱼类，由于过度捕捞、水体污染、水电站的修建等，其天然资源量急剧下降。本项目共采集了9个岩原鲤野生种群近300尾样本，运用微卫星、AFLP，mtDNA控制区分析，检测了不同地理种群的遗传多样性，探讨了种群遗传结构，对其种质保护和资源的开发利用具有重要价值。主要结果为筛选了34个具有高度多态性的微卫星位点，其中2碱基重复位点21个，4碱基重复位点12个，3碱基重复位点1个；绝大部分微卫星序列是间断型。微卫星分析显示，岩原鲤具中上水平的遗传多样性；支流种群与干流种群间(0.0243-0.0865)，以及各支流种群间的分化系数 (0.0480-0.1423)远高于干流种群间的分化系数(0.0050-0.0095)，支流和干流种群间以及各支流种群间存在明显的遗传分化。 线粒体控制区分析显示，除北碚种群外，其余种群的单倍型多样性和核苷酸多样性均较高，且经历了瓶颈效应。AFLP分析显示，各种群平均杂合度较高，相互间遗传距离较小。线粒体基因组全序列长度为16595 bp，其结构顺序和大多数脊椎动物一致；系统发育分析表明，岩原鲤位于鲃亚科和鲤亚科之间，更靠近鲤亚科。