中文摘要：

霍乱已引起七次世界大流行，在一个地区被传入并扩散是其重要的流行形式之一。深入分析流行地区的霍乱分离株，可折射所处大流行的菌株变异，更对细致分析霍乱在局部地区的传播流行、解释霍乱播散特征及提出防控策略有很高价值。我国历次大范围流行均波及山东省，其不同年代、地区的霍乱优势菌型不断转换。对数十年霍乱流行中分离株的基因组分析能更准确理解流行菌株的进化及趋势。本研究拟用脉冲场凝胶电泳等多种基因分型方法，分析1976年至今山东省霍乱菌株的基因型变迁，结合表型变化综合分析其在时间和区域的流行特征和变异规律。在大量菌株基因分型基础上，选取不同年代和菌型特征的代表株进行全基因组测序及比较基因组学研究，分析不同流行年代菌株的基因组特征和变异特点，建立不同流行期基因组特征序列，分析我国霍乱流行中在局部地区的引入、扩散过程中的基因组趋势，为揭示大流行与局部扩散特征、预测霍乱流行变异趋势提供更精细的基因组分析依据。