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全基因组micro-RNA种子区结合序列SNP标志体系与乳腺癌发病风险的关联及相关功能研究
  • 项目名称:全基因组micro-RNA种子区结合序列SNP标志体系与乳腺癌发病风险的关联及相关功能研究
  • 项目类别:面上项目
  • 批准号:81172762
  • 申请代码:H2610
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2012-01-01-2015-12-31
  • 项目负责人:陈可欣
  • 负责人职称:教授
  • 依托单位:天津医科大学
  • 批准年度:2011
中文摘要:

乳腺癌是危害女性健康的最常见恶性肿瘤之一,micro-RNA通过调控多种肿瘤相关基因参与乳腺癌发生发展。本课题组在国际上较早提出micro-RNA靶序列SNP的重要生物学意义及其在肿瘤病因中的潜在功能,并在国家自然基金资助下开展micro-RNA靶序列SNP与乳腺癌的关联研究,取得较大进展。鉴于micro-RNA靶序列SNP是一个重要的遗传标记体系,而现有靶序列SNP与肿瘤的关联研究规模较小,不足以代表此类SNP在肿瘤病因中的作用。本研究采用全基因组关联研究策略,选取符合一定频率标准的全部micro-RNA种子区结合序列SNP,通过大样本病例对照研究,检测这类SNP的基因型频率在乳腺癌患者和正常人群的分布差异,在全基因组水平建立micro-RNA种子区结合序列SNP与乳腺癌发病关联影响的标志体系,并通过功能研究解释其分子机制,希望对乳腺癌发病风险和乳腺癌患者预后的影响研究提供新的思路。

结论摘要:

乳腺癌是危害女性健康的最常见恶性肿瘤,其病因以环境暴露为主,DNA序列变异和基因表达调控起制约作用。Micro-RNA通过调控多种肿瘤相关基因参与乳腺癌发生发展。Micro-RNA靶序列SNP是一个重要的遗传标记体系,而现有靶序列SNP与肿瘤的关联研究规模较小,不足以代表此类SNP在肿瘤病因中的作用。本研究采用全基因组关联研究策略,共计纳入2744例病例和3125例对照,运用病例对照研究方法对全基因组192个micro-RNA种子区结合序列SNP基因分型,比较病例和对照的SNP基因型分布频率的差异。本研究包括关联研究和验证研究两个阶段,在在第一阶段我们选取1349例乳腺癌病例和1572例对照,用Illumina GoldenGate基因芯片法检测192个位点病例和对照的基因型,在第二个阶段我们另外选取1395例乳腺癌病例和1553例乳腺癌对照,采用TaqMan探针技术对于关联研究中获得的乳腺癌发病相关的15个micro-RNA种子区结合序列SNP和预后相关的8个micro-RNA种子区结合序列SNP进行验证。结果显示,HPGD基因(rs8752)与乳腺癌的发病风险相关,其中A基因型能够增加患乳腺癌的风险,特别是在ER+的人群中。GREM1基因(rs10318)与乳腺癌的预后相关,T基因型患者的乳腺癌特异性生存时间和无病生存时间较短。GREM1基因(rs10318)还与乳腺癌患者ER状态有关,T基因型患者ER阴性比例高。综上,本项目通过流行病学病例对照研究找到与乳腺癌发病和预后相关的microRNA靶序列SNP位点,确定了乳腺癌发病和预后的新的分子标志物,为乳腺癌病因提供了科学线索。


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
  • 10
  • 0
  • 0
  • 8
  • 0
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