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云南省单纯性室间隔缺损人群GATA4、NKX2-5和ZACN基因突变分析
  • 项目名称:云南省单纯性室间隔缺损人群GATA4、NKX2-5和ZACN基因突变分析
  • 项目类别:地区科学基金项目
  • 批准号:31160230
  • 申请代码:C060401
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2012-01-01-2015-12-31
  • 项目负责人:蒋立虹
  • 依托单位:昆明医科大学
  • 批准年度:2011
中文摘要:

先天性心脏病(CHD)是一种常见的由遗传和环境因素共同所致人类出生缺陷,发病率高达4~8‰,其中单纯性室间隔缺损(VSD)在各类CHD中发病率最高。心脏转录因子GATA4、NKX2-5和ZACN的表达异常与VSD的发生密切相关。我们在长期的CHD临床诊治工作中,积累了来自云南各地1000多病例的样本和临床材料。如何对这些病例进行深层次的分析,对于指导CHD诊治无疑具有重要的作用。本研究我们拟从前期积累的标本中选择600例VSD患者,同时选择600例对照健康人群样本,集中对转录因子GATA4、NKX2-5和ZACN基因的遗传多态进行分析,旨在揭示3个基因多态性、单倍型在VSD患者与健康人群中的分布差异,探寻影响VSD发病的风险因子。研究结果有望为VSD的预警和诊治提供遗传学依据。

结论摘要:

本研究以云南省ASD、VSD人群作为研究对象,对转录因子GATA4、NKX2-5和ZACN基因进行遗传多态进行分析,揭示3个基因多态性、单倍型在ASD、VSD患者与健康人群中的分布差异,探寻影响ASD、VSD发病可能的风险因子。研究共收集CHD患者外周血1445例,健康对照1388例。对ASD患者107例,VSD患者567例进行转录因子GATA4、NKX2-5和ZACN的基因测序,结果如下(1)在室间隔缺损患者GATA4基因第6外显子及侧翼序列、Nkx2-5基因全外显子及侧翼序列、Zac1基因第8、9外显子及侧翼序列共检测到8个新的突变位点。其中五个新发现的突变位点仅仅存在于室间隔缺损患者而不存在于房间隔缺损患者和健康对照者中,这些位点突变可能与部分室间隔缺损的发生有一定关系。(2)NKX2-5基因的rs703752位点多态性在室间隔缺损组和健康对照组间存在统计学差异,该位点基因多态性可能与室间隔缺损的发生存在一定关系;(3)在房间隔缺损患者GATA4基因上发现一个新的突变位点,该位点未在室间隔缺损组和健康对照组中发现,这个突变可能与房间隔缺损的发生存在一定关系。(4)NKX2-5基因的rs2277923位点多态性在房间隔缺损组和健康对照组间存在统计学差异,等位基因A可能是房间隔缺损发生的危险因素,而等位基因G可能是房间隔缺损发生保护性因素,rs2277923基因型AA可能与房间隔缺损发生有关。通过对5例ASD患者进行全外显子测序,我们一共筛选出先心病易感基因位点53个,这些突变位点经数据库筛选和Polyphen2软件预测为可疑致病位点。对这些可疑位点采用质谱分型的方法,在452例房间隔缺损患者中进行验证。质谱验证结果发现FOXL2基因138665410位点和SGCD基因156186376位点突变频率高,FOXL2基因和SGCD基因的突变与先天性心脏病房间隔缺损发生的关系值得进一步研究,同时138665410位点和156186376位点突变对FOXL2基因和SGCD基因的功能影响应该通过功能实验进一步明确。通过维恩分析发现的TTN基因、HYDIN基因、IGSF3基因、ZFPM基因、MYH6基因突变在房间隔缺损发生的作用有待明确。


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
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