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木薯耐低温性相关miRNA的筛选及其功能分析
  • 项目名称:木薯耐低温性相关miRNA的筛选及其功能分析
  • 项目类别:青年科学基金项目
  • 批准号:31101193
  • 申请代码:C130407
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2012-01-01-2014-12-31
  • 项目负责人:曾长英
  • 依托单位:中国热带农业科学院
  • 批准年度:2011
中文摘要:

木薯是热带地区重要的粮食作物和我国的生物能源原料作物,低温是限制其扩大种植区域和实现高产稳产的重要影响因素之一。前期对耐低温木薯SC124进行低温处理和小RNA测序,已经获得了52个低温诱导表达的miRNA。本研究将在此基础上,开展1)验证52个miRNA的低温响应特性,分离被验证的miRNA基因启动子区,筛选启动子区具备低温响应顺式元件的miRNA基因;2)预测筛选后miRNA的靶基因,经miRNA:靶基因互作验证和表达量消长关系分析,确定耐低温性相关的关键miRNA;3)克隆关键miRNA在耐低温性差异较大的木薯品种的靶基因,结合两者表达量的消长关系和剪切位点与频率的差异,阐述靶基因遗传多态性与miRNA对靶基因调控效率间的关系。通过本研究,将获得木薯耐低温性相关的关键miRNA基因资源,解析miRNA在木薯耐低温过程中对靶基因的调控机制,为木薯耐低温的遗传改良提供理论支持。

结论摘要:

为研究木薯驯化处理提高木薯耐寒性的机理,本项目通过对木薯品种SC124经过和不经过低温驯化与对照处理等的小RNA数据和转录组数据的比较分析,共鉴定了154个miRNA(其中61个为未被报道的新miRNA),并筛选了62个表达差异显著的miRNA(39个为已知miRNA,23个为新miRNA)。综合同一样品miRNA和mRNA与对照的表达量变化,发现1454对差异miRNA与其差异靶基因在表达量上存在较明显的消长关系,5’RACE实验验证了其中11对miRNA靶基因的在mRNA水平上的剪切事件。此外,我们发现14度亚低温胁迫可特异性地诱导小分子营养物质的储备,使得木薯启动类似于免疫抗性的产生以抵抗更低的低温。但没有经过14度驯化的冷激处理则是诱导类似于病毒入侵的坏死反应。进一步研究发现Novel-4启动子区检测到多个与胁迫相关的顺式作用元件,可在低温和干旱下,通过对其靶基因M20/M25/M40肽酶家族007251m成员的mRNA进行剪切,实现novel-4对低温和干旱胁迫的共同响应。通过本研究,获得了木薯耐低温性相关的miRNA和功能基因资源,为木薯耐低温的遗传改良打下良好基础。项目执行期间发表了3篇SCI论文,3篇国内核心期刊论文,毕业了1名博士和3名硕士。


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
  • 6
  • 0
  • 0
  • 0
  • 0
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