中文摘要：

石耳目（Umbilicariales J.C. Wei & Q.M. Zhou）是子囊菌纲的一个新目，由周启明与魏江春于2007年以石耳科（Umbilicariaceae）为基础，基于形态特征及分子数据建立的。该目发表时含3科4属，约110种。近年来，国外研究者基于少量分子数据的研究结果又将两个科- - Fuscideaceae及Ophioparmaceae置于石耳目中，目前该目含5科13属，近200种。然而，属于Fuscideaceae及Ophioparmaceae的地衣与石耳科地衣在形态上差异较大，它们是否适合置于石耳目中值得探讨。此外，该目中的某些属级分类单元，譬如Hypocenomyce及Boreoplaca，其系统发育地位仍有待进一步澄清。因此，本项目将通过形态解剖特征与多种分子数据相结合的方式，对现有石耳目中的多个类群之间的关系进行仔细研究，从而阐明石耳目地衣的系统地位。

结论摘要：

本项目在采集国内及南北极地区1800余份石耳目地衣标本的基础上，采用形态特征与多种分子数据相结合的方法，对石耳目地衣及该目中关键属、疑难属的分类地位进行仔细研究。通过本研究，我们首次发现部分石耳属地衣物种的基物具有多样性，丰富了我们对石耳目地衣的认识；并确定了石耳目地衣包含4个科级分类单元Umbilicariaceae、Elxiaceae、Fuscideaceae及Ophioparmaceae；但Fulgidea及Xylopsora二属的系统地位仍有待进一步澄清。此外，以石耳属地衣为材料，对石耳属地衣的系统发育、表型进化与基因型的对应关系以及分子水平上物种界限进行了详细研究；并讨论了使用ITS序列用作该属DNA条形码的可行性。本研究进一步涉及到地衣共生菌藻的对应关系及地衣化的起源与进化，为揭示多个地衣类群之间的发育关系提供了新的思路。