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表达序列标签和生物信息学辅助克隆鱼类新免疫功能基因
  • 项目名称:表达序列标签和生物信息学辅助克隆鱼类新免疫功能基因
  • 项目类别:面上项目
  • 批准号:30371096
  • 申请代码:C190601
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2004-01-01-2006-12-31
  • 项目负责人:邵健忠
  • 负责人职称:教授
  • 依托单位:浙江大学
  • 批准年度:2003
中文摘要:

应用日益增长的鱼类表达序列标签数据库生物信息资源和电子克隆及数字化差异表达分析等生物信息学技术,快速搜索鉴定5种人类和高等脊椎动物重要免疫功能基因(QM、NKEF、PBEF、IRF和ILF)在鱼类中的同源基因。在此基础上,通过RT-PCR、5'RACE-PCR、3'RACE-PCR或cDNA文库筛选技术,克隆出鱼类(斑马鱼、青鳉等)QM、NKEF、PBEF、IRF和ILF全长cDNA基因,并阐明基因结构与分子进化规律,完成基因的染色体定位,为进一步开展该5种基因在鱼类中的免疫生物学功能研究奠定基础。通过本项目研究,建立生物信息学辅助大规模快速克隆鱼类功能基因的新技术方法体系,加快鱼类基因分子生物学研究进程,对揭示免疫系统的发生发展以及免疫基因的分子起源与进化规律,阐明鱼类免疫基本规律及其基因调控机理,促进鱼类免疫学发展和病害防治研究,具有重要的理论和实践意义。

结论摘要:

本项目利用表达序列标签和比较基因组学等生物信息学技术,成功地在斑马鱼、河豚和草鱼等鱼类中分离鉴定了一批重要免疫功能新基因,包括Wilms'肿瘤抑制基因(QM)、天然杀伤细胞增强因子基因(NKEF-A和NKEF-B)、前淋巴细胞增强因子基因(PBEF)、白细胞介素-2结合增强因子基因/核转录因子45(ILF-2/NF45)、细胞因子信号转导抑制因子-3基因(SOCS-3)以及多种干扰素调节因子基因(IRF-1、IRF-2、IRF-6和IRF-7)和白细胞介素基因(IL-2、IL-4、IL-15、IL-16和IL-21),系统地研究了这些基因的结构特点、表达调控元件、分子进化规律、染色体定位、组织细胞来源以及免疫生物学功能,其中对QM、NKEF-B、ILF-2/NF45、SOCS-3、 IL-4、IL-15、IL-16和IL-21等的研究,在国际上尚属首次,具有明显的创新性。通过本项目研究,建立了生物信息学辅助克隆鱼类免疫功能基因的新技术和方法体系,丰富了鱼类免疫学的研究内容,推动了鱼类免疫功能基因研究的进程,具有重要的科学意义和潜在应用价值。


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
  • 21
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