位置:立项数据库 > 立项详情页
运用SAGE大规模鉴定水稻基因组中的新基因
  • 项目名称:运用SAGE大规模鉴定水稻基因组中的新基因
  • 项目类别:面上项目
  • 批准号:30370330
  • 申请代码:C050202
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2004-01-01-2004-12-01
  • 项目负责人:张秀清
  • 负责人职称:副研究员
  • 依托单位:中国科学院北京基因组研究所
  • 批准年度:2003
中文摘要:

本研究利用基因表达系列分析(SAGE)的方法探讨了杂交水稻(两优培九,LYP9)与两个亲本(父本为籼稻93-11,母本为光温敏核雄性不育的PA64S)三个组织(穗、叶、根)转录组特征。从SAGE文库中共获得465,679个随机标签,对应于68,483种唯一性的标签。初步分析了获得全长cDNA支持的部分数据以及在杂交水稻中差异表达达到显著水平的标签(基因)。鉴定了595个在LYP9中表达显著上调(P<0.01)的基因(穗组织中22个、叶中228个、根中345个)以及25个表达下调的基因(穗中7个、叶中15个、根中3个)。大部分上调基因涉及碳和氮同化作用的加强,包括叶中的光合作用、根中的氮吸收、根和穗的快速生长。下调的基因包括一个光呼吸作用的关键酶(丙氨酸甘氨酸氨基转移酶1)。本研究结果为杂种优势和水稻基因调控网络的分子机理研究提供了崭新的重要数据。

结论摘要:

英文主题词hybrid rice;SAGE; heterosis


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
  • 1
  • 0
  • 0
  • 0
  • 0
相关项目
期刊论文 14 会议论文 5
期刊论文 9 会议论文 1
张秀清的项目