虹彩病毒是养殖石斑鱼中新近出现的最严重的传染性病毒之一。目前尚不清楚鱼类虹彩病毒基因转录、复制和表达的分子生物学机制,没有有效办法对该病毒进行防治。在拥有石斑鱼虹彩病毒细胞培养系统和病毒基因组数据库基础上,本项目将利用DNA微阵列技术在全基因组水平研究分析一种新的高致病石斑鱼虹彩病毒的基因转录图谱,确认并鉴定病毒在转录与复制过程中的即发行早期(IE)、早期(E)和晚期(L)基因。同时利用Real-time PCR 技术分析病毒功能基因的表达和调控。通过本研究,我们可了解石斑鱼虹彩病毒发生、复制和感染致病的分子机制,具有重要的科学意义。同时,为有针对性地研制和开发药物、疫苗和检测试剂打下坚实基础,具有重要的应用实践意义。
新加坡石斑鱼虹彩病毒(Singapore grouper iridovirus, SGIV)是近年来新出现的一种严重的鱼类传染性病毒。目前尚不清楚这种病毒感染和致病的分子机理,缺乏有效的办法对病毒进行防治。因此,在基因和分子水平上研究这种病毒显得尤为必要。本研究根据全基因组序列信息,成功构建了包含SGIV 162个ORFs在内的全基因组DNA芯片;运用DNA microarray技术完成了SGIV体外感染石斑鱼脾细胞(GS)和体内感染石斑鱼脾组织的转录图谱,初步界定出SGIV三类不同表达时相的转录本;采用Real-time RT-PCR、RT-PCR和dilution RT-PCR等技术验证了芯片数据的可靠性;对SGIV诱导的宿主细胞凋亡进行了系统性的研究,SGIV诱导的细胞凋亡具有明显的细胞特异性,具有时间和病毒感染强度的依赖性和细胞特异性。凋亡的发生无需病毒的复制,病毒编码的与凋亡相关的蛋白对凋亡的发生起着重要的调控作用。本研究对揭示了新加坡石斑鱼虹彩病毒基因复制、转录和翻译调控的分子机制,以及病毒与宿主相互作用的分子机理奠定了基础 ,为寻找有效的抗病毒对策提供了理论支持。