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细菌基因组DNA磷硫酰化修饰的位点选择及其机理研究
  • 项目名称:细菌基因组DNA磷硫酰化修饰的位点选择及其机理研究
  • 项目类别:面上项目
  • 批准号:30870038
  • 申请代码:C010201
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2009-01-01-2011-12-31
  • 项目负责人:梁晶丹
  • 负责人职称:讲师
  • 依托单位:上海交通大学
  • 批准年度:2008
中文摘要:

细菌DNA磷硫酰化修饰是首次发现的DNA磷酸骨架上的生理修饰。项目对含有DNA硫化修饰的E.coli B7A、Streptomyces lividans 1326、Streptomyces avermitilis、Salmonella enterica serovar Cerro isolates 87及Pseudomonas fluorescens PfO-1五个菌株的基因组具体修饰位点进行了大规模鉴定。通过物种内修饰位点的DNA序列比对,求出了修饰发生的保守顺序。利用已知的基因组序列对发生修饰的位点进行了定位,统计修饰发生在基因间或基因内的比例,探索了DNA硫化修饰的基因组位置规律性。通过体内遗传学和体外DNA-蛋白相互作用实验,确定相关Dnd蛋白的序列选择功能,为透彻阐明细菌磷硫酰化的生理意义奠定基础。

结论摘要:

英文主题词Phosphorothioate; DNA modification; DNA modification by sulphur; DNA degradation (Dnd); Activated Tris buffer


成果综合统计
成果类型
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