本课题在面向生物学文献的本体提取和应用方面开展了大量的研究,包括(1)面向生物医学文献中无结构的正文,开展基于本体的蛋白质作用关系的深层语言关系挖掘的研究;(2)在对生物文献的正文进行语义挖掘的同时,从生物文献结构数据库中抽象出生物文献背后的概念和概念的属性以及概念之间关系,对其进行本体建模并开展竞争分析的研究;(3)基于本体将生物文献挖掘结果与高通量的实验数据进行整合,开展了疾病-基因-药物关联关系的研究。我们在生物医学文本提取的著名国际评测BioCreative中,取得第一名的优异成绩;开发和发布了本体的生物学关系提取系统(ONBIRESONtology-based BIological Relation Extraction System),并挂靠在生物信息网格上,实现了网络服务的提供。
英文主题词Biomedical Ontology; Literature Mining; Data Mining; Information Integration