位置:立项数据库 > 立项详情页
I型内含子结构组学及其系统演化研究
  • 项目名称:I型内含子结构组学及其系统演化研究
  • 项目类别:重大研究计划
  • 批准号:90608025
  • 申请代码:C050202
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2007-01-01-2009-12-31
  • 项目负责人:张翼
  • 负责人职称:研究员
  • 依托单位:武汉大学
  • 批准年度:2006
中文摘要:

I型内含子核酶是研究RNA结构与功能的重要模式分子。该项目执行前,人们普遍认为I型内含子存在于低等真核生物和少数原核生物中,鉴定出来的I型内含子约2500种。本项目通过比对分析获得1789个内含子的高可信度序列比对结果,覆盖所有已知的14个亚类,并且获得它们的二级结构。在此基础上,我们获得每个亚类的CM model,用它搜索一个结构RNA数据库,通过我们提供的验证参数筛选,获得了约17000个I型内含子,并且发现95%来自于植物(低等到高等)的叶绿体。该发现完全拓展了人们对I型内含子的分布认识。该项目构建了世界上第一个I型内含子结构数据库(GISSD, http://www.rna.whu.edu.cn/gissd/)。该数据库提供每个内含子所在的宿主及其演化树。该数据库提供的结构信息对揭示了I型内含子结构与折叠的关系具有重要贡献,在此基础上,该项目研究了两个I型内含子的结构与折叠关系。

结论摘要:

英文主题词group I intron;database; structure;folding;RNA


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
  • 3
  • 0
  • 0
  • 0
  • 0
相关项目
张翼的项目
会议论文 1 著作 2
期刊论文 9 会议论文 10