I型内含子核酶是研究RNA结构与功能的重要模式分子。该项目执行前,人们普遍认为I型内含子存在于低等真核生物和少数原核生物中,鉴定出来的I型内含子约2500种。本项目通过比对分析获得1789个内含子的高可信度序列比对结果,覆盖所有已知的14个亚类,并且获得它们的二级结构。在此基础上,我们获得每个亚类的CM model,用它搜索一个结构RNA数据库,通过我们提供的验证参数筛选,获得了约17000个I型内含子,并且发现95%来自于植物(低等到高等)的叶绿体。该发现完全拓展了人们对I型内含子的分布认识。该项目构建了世界上第一个I型内含子结构数据库(GISSD, http://www.rna.whu.edu.cn/gissd/)。该数据库提供每个内含子所在的宿主及其演化树。该数据库提供的结构信息对揭示了I型内含子结构与折叠的关系具有重要贡献,在此基础上,该项目研究了两个I型内含子的结构与折叠关系。
英文主题词group I intron;database; structure;folding;RNA