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中文摘要：
蛋白质与药物的相互作用计算是合理化药物设计的基础。然而目前由于受到分子力场参数精度的限制，相互作用能的预测精度有待提高。在本项目的研究中，我们进一步推广蛋白质专一性极化力场在蛋白质药物分子对接、分子模拟、热力学性质计算等生物体系的研究中，取得了一定的成果，同时也证实了静电极化效应在生物大分子体系研究的必要性和有效性。另一方面，我们在原有极化电荷的基础上发展出实时拟合的极化电荷，用于蛋白质折叠的研究，模拟了含有单一alpha螺旋结构的多肽的折叠。为了降低计算的负担，我们将静电极化拟合成经验公式，增强了极化电荷的实用性。综合以上结果，我们从结构、能量、动力学和热力学几个方面证明了极化电荷的有效应，为计算生物学研究提供了一套有效的工具。
结论摘要：
英文主题词protein; polarization; drug design; molecular modeling
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