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肝脏及肝病相关的系统生物学研究
  • 项目名称：肝脏及肝病相关的系统生物学研究
  • 项目类别：创新研究群体科学基金
  • 批准号：30621063
  • 申请代码：C07
  • 项目来源：国家自然科学基金
  • 研究期限：2007-01-01-2009-12-31
  • 项目负责人：贺福初
  • 负责人职称：研究员
  • 依托单位：中国人民解放军军事医学科学院
  • 批准年度：2006
中文摘要：

本课题在延续"胎肝蛋白质组学及重要细胞调控因子的发掘"的基础上，继续围绕人类肝脏的重大生理和病理问题，同时将研究对象扩展到了成人肝脏和肝脏疾病，并引入系统生物学的思想和技术手段，开展了具有重要意义而在前期研究中缺失的低丰度蛋白质和翻译后修饰蛋白质的挖掘，构建了更高覆盖率的肝脏蛋白质表达谱、修饰谱，并实现"两谱"的完整定量描述，以及更高通量、更大规模的肝脏蛋白质连锁图和定位图。在重要细胞调节因子及疾病易感性研究方面取得了显著进展。2007-2009年，共发表国际论文55篇，影响因子总和为397.04，单篇平均影响因子达7.2。另外，获得中国发明专利和软件著作权共9项。

中文主题词：
成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
  • 96
  • 34
  • 0
  • 10
  • 4
期刊论文
一种改良的小鼠肝窦内皮细胞的分离、纯化、培养及鉴定方法
Liver proteome analysis of adaptive response in rat immediately after partial hepatectomy.
Two-dimensional blue native/SDS PAGE analysis reveals HSPs chaperone machinery involved in HBV produ
The molecular hinge for regulation of hepatogenesis and hematopoiesis in mouse fetal liver explored
Proteome-wide prediction of signal flow direction in protein interaction networks based on interacti
Mass Measurement Errors of Fourier-Transform Mass Spectrometry (FTMS): Distribution, Recalibration,
Liverbase: a comprehensive view of human liver biology.
Systematic –omics analysis of HBV-associated liver diseases.
Histone methyltransferase protein SETD2 interacts with p53 and selectively regulates its downstream
JAB1 interacts with pro-apoptotic BH3-only BclGs and involved in the regulation of mitochondrial apo
C-type lectin LSECtin interacts with DC-SIGNR and is involved in hepatitis C virus binding.
Deactivation of IKK by CUE domain containing 2 (CUEDC2) via recruitment of the protein phosphatase P
A strategy for precise and large-scale identification of core fucosylated glycoproteins.
Bayesian nonparametric model for the validation of peptide identification in shotgun proteomics.
E3 ubiquitin ligase SIAH1 mediates ubiquitination and degradation of TRB3.
PACT is a negative regulator of p53 and essential for cell growth and embryonic development.
Differential regulation of Apak by various DNA damage signals.
First insight into human liver proteome from PROTEOMESKY-LIVERHu 1.0, a publicly-available database.
KRAB-type zinc-finger protein Apak specifically regulates p53-dependent apoptosis
Proteomic screen defines the Hepatocyte Nuclear Factor 1binding partners and identifies HMGB1 as a n
A nonparametric model for quality control of database search results in shotgun proteomics.
Targeting WW domains linker of HECT-type ubiquitin ligase Smurf1 for activation by CKIP-1.
Functional polymorphisms in the promoters of MMP-1, MMP-2, MMP-3, MMP-9, MMP-12 and MMP-13 are not a
CUE domain containing 2 regulates degradation of progesterone receptor by ubiquitin proteasome
Systematic characterization of the covalent interactions between (—)-epigallocatechin gallate and pe
Nuclear protein IkappaB-zeta inhibits the activity of STAT3.
Exploring rat plasmatic proteomes: what triggered the liver regeneration
Human Proteinpedia enables sharing of human protein data.
A New Strategy to Filter out False Positive Identifications of Peptides in SEQUEST Database Search R
NuSAP is degraded by APC/C-Cdh1 and its overexpression results in mitotic arrest dependent of its mi
Phosphoproteome Profile of Human Liver Chang’s cell Based on 2-DE with Fluorescence Staining and MAL
Lack of support for an association between CLEC4M homozygosity and protection against SARS coronavir
Proteome analysis of hepatocellular carcinoma by two-dimensional difference gel electrophoresis: nov
Functional Polymorphisms and Haplotype in the Promoter of MMP-2 Gene Are Associated with Risk of Nas
MDM2 Promoter SNP309 is Associated with Risk of Occurrence and Advanced Lymph Node Metastasis of Nas
The Function Study on the Interaction between Grb2 and AMPK.
Lack of Association between the Functional Polymorphisms in the Estrogen-metabolizing Genes and Risk
No association of MMP-7, MMP-8, and MMP-21 polymorphisms with the risk of hepatocellular carcinoma i
A HUPO test sample study reveals common problems in mass spectrometry–based proteomics.
PRINCESS: a Protein Interaction Confidence Evaluation System with multiple data Sources.
A Protein Interaction Dataset Highlighted with Ras-MAPK/PI3K Signaling Pathways.
Quantitative proteome analysis of HCC cell lines with different metastatic potentials by SILAC.
Ceap/BLOS2 interacts with BRD7 and selectively inhibits its transcription-suppressing effect on cell
基于质谱技术的蛋白质组定量方法
反相高效液相色谱双梯度洗脱分离肽混合物及质谱分析
细胞凋亡中的核/质转运
Ｃ型凝集素受体与抗真菌免疫
系统生物学研究中不同组学数据的整合
PTEN基因多态性与中国人群鼻咽癌遗传易感性的相关性研究
基于局部回归的色谱保留时间对齐可逆算法
强阳离子交换色谱分离多肽混合物的条件优化
基于稳定同位素标记与质谱分析的蛋白质定量算法研究进展
蛋白质组学质谱平台肽段可检测性预测研究进展
胍基化修饰结合稀土金属标记应用于蛋白质相对定量研究
泛素样分子FAT10研究进展
丙型肝炎病毒非结构蛋白NS2的研究进展
蛋白质相互作用调控蛋白质核转运及其功能
胞内接头蛋白TRAFs家族
蛋白质翻译后修饰及定位对p53活性的调节作用
22周孕龄人胎肝表达序列标签数据更新与初步分析
基于生物信息学方法发现潜在药物靶标
一种基于基因表达模型识别酵母细胞周期条件特异调控子网的方法
多层开管毛细管酶反应器的制备及在蛋白质酶切中的应用
生长抑制因子（ING）抑癌基因家族的研究进展
蛋白质组学中新蛋白质鉴定的研究方法和策略
PNmerger：一个整合生物学通路和蛋白质相互作用网络的Cytoscape插件
蛋白质相互作用网络进化分析研究进展
MetaGen:从KEGG建模代谢网络的新工具(英文)
基因调控网络的模块化组织研究
An integrated view of the correlations between genomic and phenomic variables
突变体p53研究进展
组蛋白甲基转移酶的研究进展
寡糖衍生化及基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱分析方法研究
高效硅胶化学键合固定相的研究进展
分离分析技术在蛋白质组学研究中应用的新进展
反相毛细管整体柱的制备及其在多肽混合物分离中的应用
一种蛋白质质谱分析中快速胍基化新方法
鸟枪法蛋白质鉴定质量控制方法研究进展
会议论文
基因多态性在HBV相关肝病遗传病因研究中的应用
中国人群常见肿瘤的遗传易感性研究
PROTEOMICS: THE CHANCE AND CHALLENGE FOR ANALYTIC SCIENCES
Apak和PACT等新的p53调控分子的鉴定与功能研究
CKIP-1 functions as a critical cofactor of Smurf1 E3 ligase in regulation of adult bone mass
系统生物学：肿瘤转移研究中的“中流”转移
肝癌的系统生物学研究
基于液相色谱-串连质谱的糖基化蛋白质组研究策略
Systematic -omics analysis of HBV-associated Hepatocellular Carcinoma
First insight into human liver proteome. Human Liver Proteome Project
Expression and Modification Profiling of Human Liver Proteome
New Methods and Techniques Based on Biological Mass Spectrometry for Quantitative Proteomics
The Insight into the Human Liver Proteome
Genetic Susceptibility to Common Cancers of Chinese. 7
The associations between the polymorphisms and the HBV-related diseases and SARS
CKIP-1 is a critical cofactor of Smurf1 E3 ligase in regulation of adult bone mass.
The Insight into the Human Liver Proteome
蛋白质组生物信息研究
人类蛋白质组计划及中国的贡献
骨形成负调控分子CKIP-1对泛素连接酶Smurf1的调控研究。
人类蛋白质组计划及其中国的贡献
HECT类泛素连接酶Smurf1的E3活性调节新机制及对Mdm2的调控功能
The molecular hinge for regulation of hepatogenesis and hematopoiesis in mouse fetal liver explored
Induction of SOX4 by DNA damage is critical for p53 stabilization and function
PACT is a negative regulator of p53 and essential for cell growth and embryonic development
Systematic insight on human liver proteome
dbLEP: A Database of Liver Proteome Expression Profile
KRAB-type zinc-finger protein Apak specifically regulates p53-dependent apoptosis
A New Method for Quantitative Proteomics by Combining Chemical Modification with LTQ-FT Mass Spectro
HECT类泛素连接酶Smurf1的酶活调控新机制
KRAB型锌指蛋白家族在p53调控与DNA损伤应答中的功能
Systematic -omics analysis of HBV-associated Hepatocellular Carcinoma
Precise and Large Scale Identification of Core Fucosylated Glycoproteins
泛素连接酶Smurf1的功能与调控
获奖
人类蛋白质组组织成就奖
质谱新方法与解析新技术及其在蛋白质组研究中的应用
蛋白质组支撑技术及其在人类重要疾病与生理过程研究中的应用
88-1研究
肿瘤细胞的泛素调节机制研究
人类蛋白质组组织成就奖
质谱新方法与解析新技术及其在蛋白质组研究中的应用
蛋白质组支撑技术及其在人类重要疾病与生理过程研究中的应用
88-1研究
肿瘤细胞的泛素调节机制研究
著作
《工业蛋白质组学——在生物技术和制药中的应用》
《色谱在生命科学中的应用》
《蛋白质定向、转运及转位》
《系统生物学的理论、方法和应用》
贺福初的项目
新型人源细胞内物质转运调节因子ARFGAP1的功能研究
期刊论文 4
LSECtin负调控T细胞免疫及其参与肝脏免疫耐受的机制研究
期刊论文 6
第三届国际人类蛋白质组大会
酪蛋白激酶2 相互作用蛋白1 在骨组织中调控成骨细胞参与骨形成的分子机制与骨质疏松成骨治疗研究
人类健康和疾病的蛋白质组学研究人类及鼠肝脏样本的细胞器水平分析(中加健康研究合作计划)
新发现人源造血相关转录因子hBKLF的功能研究
期刊论文 1
第六届中国蛋白质组学大会
肝脏不同细胞类型蛋白质组生物特性研究
期刊论文 11 获奖 8
生物大数据发展战略研究
第六届亚太人类蛋白质组大会
肝与模式细胞蛋白质组国际研讨会
人胎肝造血干细胞增殖刺激物及其受体的分子生物学研究
人胎肝蛋白质组学及重要细胞调控因子的发掘
期刊论文 84 会议论文 56 获奖 12 著作 1
细胞生物学及发育生物学
人胎肝来源抑瘤因子的ｃＤＮＡ分离
生命组学发展战略与对策研究
第八届中国蛋白质组学大会