早期研究模式识别的方法、理论和应用,为国民经济作出了一定的贡献,获国家科技进步二等奖、中国海洋石油总公司科技进步一等奖、国家教委科技进步二等奖、茅以升北京青年科技奖等。在国内较早开展关于统计学习理论和支持向量机的研究,在此方向发表的首篇国内论文已被引用426次,为我国这一学科的发展做出了贡献。2001年开始投身生物信息学研究,迅速地从单纯的算法研究深入到很多前沿生物学问题内部,已在基因表达数据的分析和挖掘