蛋白质折叠过程中的结构变异可能导致'折叠病',比如老年痴呆症、多聚谷氨酰胺疾病等。因此蛋白质折叠研究对于揭示'折叠病'致病机理有重大意义。本项目将研究蛋白质折叠的高效模拟方法;并以多聚谷氨酰胺疾病为例,探索'折叠病'的致病机理。具体内容包括提出蛋白质侧链的系统研究方法;研究蛋白质折叠高效并行算法;研究多聚谷氨酰胺误叠和聚集的致病机理。其中前两方面工作是本项目中蛋白质折叠高效模拟方法的重要组成部分;该高效模拟方法将被用于研究'折叠病'的致病机理,有如下特点(1)全面系统分析侧链在蛋白质折叠中的作用;(2)基于圆周统计模型,更准确描述物理量热动力学涨落和涨落关联;(3)蛋白质结构空间高效搜索、正则系综内物理量高效计算及系统状态密度函数高效计算。本项目拟建立的高效模拟方法对于促进我国蛋白质折叠的基础算法研究以及折叠病致病机理的应用研究有着重要意义。
英文主题词Protein folding;Parallel Mento Carlo Algorithm;Protein Structure Prediction;Folding Disease;drug design