本项目以中国大陆科学深钻工程5000米主孔和多口浅孔获得的固体和流体样品为主线,结合钻探孔区地表地质、深部地球物理、井中原位测量和现场实验测试结果,通过地质学、地球化学、地球物理与生物学等多学科综合研究,建立钻孔的岩相学、矿物学、地球化学、流体化学、流变学、构造学、岩石物理和微生物连续变化剖面,从平面和地下深部三维空间揭示大陆板块会聚边界深部的物质组成与结构,再造超高压变质岩石的形成与折返机理,验证地球物理对地壳深部的探测结果,探索现代地下深部流体的成分、分布及成因,研究地下极端条件下微生物的类型、分布及潜育条件,实现国家重大科学工程―中国大陆科学钻探项目的总体科学目标,在大陆动力学重大地学前沿研究方面、在地下水圈与生物圈探索方面取得创新性的成果,使我国在大陆科学钻探及相关研究领域在国际上占有一席之地。