微进化的极致莫过于个体发育过程里细胞分裂发生的突变和导致的后果。如果对个体发育过程的突变规律不甚了解,那么推断微适应性进化就难于深入。直到最近为止,由于没有足够的实验数据和分析方法,使得人们对其了解甚少。我们近期的一项持续4年的大规模突变筛选,为揭示果蝇种系谱系发育过程突变规律提供了难得的数据;而新一代测序技术也让大规模检测个体内细胞间分子差异正逐渐成为现实。本项目将针对现有和未来数据资源,发展和完善用于果蝇及人类种系突变研究的细胞溯祖理论、样本模拟算法和统计分析方法,全面了解果蝇种系突变规律和为未来研究人类种系突变奠定基础。具体包括1)建立和完善细胞溯祖理论及模拟算法;2)开发新的统计分析方法;3)全面地分析果蝇突变数据,包括检验自然选择、种系发育动态的各种假设等;4)开发可应用于新一代测序技术产生的数据的细胞溯祖理论和方法,及其最佳的实验设计,包括样本大小,测试长度和测试精度。
英文主题词cell coalescent;germlline lineage;Drosophila;simulation algorithm;mutation analysis