中文摘要：

本研究在比较分析三株鼠疫耶尔森氏菌全基因组序列的基础上，采用抑制消减杂交、DNA芯片比较基因组杂交、大规模位点特异性PCR等比较基因组学研究技术，分析大量遗传多态性位点（基因点突变、基因组内重排、基因获得、基因缺少）在中国鼠疫菌自然分离株中的差异分布，根据各菌株的遗传多态性图谱，建立全新的鼠疫菌基因组分型系统，据此进行鼠疫菌微进化分析，认识鼠疫菌基因组微进化的基本规律，认识基因组微进化与鼠疫菌生态

结论摘要：

鼠疫耶尔森氏菌（以下简称鼠疫菌）是鼠疫的病原体，历史上曾引起三次世界鼠疫大流行。鼠疫菌是在1,500-20,000年前由假结核耶尔森氏菌进化而来的，作为一个新生的病原体，正处于进化的活跃时期。本研究在比较分析三株鼠疫耶尔森氏菌全基因组序列的基础上，采用抑制消减杂交、DNA芯片比较基因组杂交、大规模位点特异性PCR等比较基因组学研究技术，以假结核耶尔森氏菌为参照，分析大量遗传多态性位点（基因点突变、基因组内重排、基因获得、基因缺失）在中国鼠疫菌自然分离株中的差异分布，根据各菌株的遗传多态性图谱，建立全新的鼠疫菌基因组分型系统，据此进行鼠疫菌微进化分析，认识鼠疫菌基因组微进化的基本规律，认识基因组微进化与鼠疫菌生态位适应和毒力分化之间的关系，认识各型别菌株栖息于特定生态位中的机理，认识鼠疫菌在中国传播和演化的规律，建立中国鼠疫菌遗传多态性文库，在鼠疫爆发流行和生物恐怖事件中，可用于病原菌的来源追踪分析。