作为表观遗传改变的主要形式,DNA甲基化具有肿瘤细胞特异性且其改变是可逆的,但CpG岛中每个CpG位点的甲基化几率并不均一,只有位于重要转录因子或阻抑子结合部位的关键性CpG位点的甲基化才能阻断基因的转录。作为重要的抑癌基因,申请者在前期的研究中发现,异常甲基化是RASSF1A在肿瘤中失活的主要方式,但迄今为止,其关键性CpG位点的分布及遗传背景对其甲基化发生的影响尚未阐明。本研究通过检测食管癌中RASSF1A基因关键性CpG位点来明确此基因甲基化发生的主要位点,结合生物信息学的方法探讨关键性CpG位点的甲基化对转录因子结合的抑制作用,并对比分析散发性及家族聚集性食管癌中此基因的甲基化状况,为明确RASSF1A基因的关键性CpG位点及作用机制提供实验数据和理论依据,可对今后此基因甲基化研究中CpG位点的选取提供参考和指导,并可为食管癌的治疗和预后提供分子靶点。
esophageal cancer;RASSF1A;methylation;critical CpG sites;
作为表观遗传改变的主要形式,DNA甲基化具有肿瘤细胞特异性且其改变是可逆的,但CpG岛中每个CpG位点的甲基化几率并不均一,只有位于重要转录因子或阻抑子结合部位的关键性CpG位点的甲基化才能阻断基因的转录。作为重要的抑癌基因,申请者在前期的研究中发现,异常甲基化是RASSF1A在肿瘤中失活的主要方式,但迄今为止,其关键性CpG位点的分布及遗传背景对其甲基化发生的影响尚未阐明。本课题通过检测食管癌中RASSF1A基因目的CpG岛中的关键性CpG位点来进一步明确此基因甲基化发生的主要位点,结合生物信息学的方法及通用模型来描述关键性CpG位点的甲基化对转录因子结合的抑制作用,选取其中有意义的关键性CpG位点进一步通过实验来验证其甲基化对转录的抑制作用,并对比分析了散发性及家族聚集性食管癌中此基因的甲基化状况。本课题按照计划书的既定计划,有条不紊地进行了深入的研究,已基本完成计划书中的既定任务和科研研究工作,初步的研究结果显示食管癌中RASSF1A基因-453~131区域的目的CpG岛内存在关键性CpG位点,这些位点的异常高甲基化与此基因在食管癌中的表达存在相关性,且这些关键性CpG位点发生高甲基化后可通过阻碍多种转录因子与启动子的结合而影响基因的转录和表达,散发性和家族聚集性食管癌患者RASSF1A基因的甲基化改变可能存在差异,提示遗传背景在甲基化发生过程中可能有一定作用,RASSF1A的甲基化改变有可能是食管癌预后判断的一个重要指标,对其甲基化的逆转有望成为食管癌基因治疗的分子靶点。迄今为止,已发表与本课题有关的研究性论文6篇,其中SCI论文3篇,中文核心期刊论文3篇。