多聚腺苷化[poly(A)]及选择性多聚腺苷化(APA)是基因表达调控的重要途径,是由poly(A)信号调控的。Poly(A)信号对剪切、转录终止及翻译起关键作用。仍有超过20%的动物及高达90%的植物非典型poly(A)信号的特征有待识别,且新发现的与反向转录或转录通读有关的APA位点的调控机制也尚不清晰。基于多年研究基础,本项目拟从全基因组水平分析海量测序数据,识别poly(A)信号的一级序列及二级结构特征;分析新发现不同类型APA位点的poly(A)信号,构建poly(A)信号共调网络;建立poly(A)信号动态分析模型,系统研究不同真核生物poly(A)信号演化模式;开发poly(A)信号识别与分析的生物信息可视化平台。此研究有利于从反向转录和通读等新视角探索APA机制,能加深对poly(A)信号起源与进化的认识,也有助于3'末端加工相关疾病的治疗及更深入了解复杂的转录后调控机制。
英文主题词polyadenylation signal;post-transcriptional regulation;secondary structure;genomics data;evolutionary analysis