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黄瓜无侧枝基因的精细定位及候选基因分离
  • 项目名称:黄瓜无侧枝基因的精细定位及候选基因分离
  • 项目类别:面上项目
  • 批准号:31071081
  • 申请代码:C060102
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2011-01-01-2013-12-31
  • 项目负责人:蔡润
  • 负责人职称:教授
  • 依托单位:上海交通大学
  • 批准年度:2010
中文摘要:

侧枝性状是黄瓜的重要农艺性状之一。我国黄瓜生产中,少侧枝或无侧枝的品种可以提高产量。本项目将利用无侧枝的黄瓜自交系S61开展无侧枝基因(non-lateral-branch, nlb)的研究。通过不同群体的遗传分析,研究不同基因背景对黄瓜无侧枝性状的影响。利用SRAP和SSR等标记技术,筛选出与无侧枝基因紧密连锁的分子标记,并进行精细定位,然后通过黄瓜全基因组序列和BAC文库,图位克隆获得nlb候选基因,并进行功能分析和转化互补验证,探讨其对侧枝形成和生长发育的调控途径。本研究将有助于黄瓜高产品种的选育,促进黄瓜侧枝发育的分子生物学研究。

结论摘要:

利用黄瓜基因组测序开发的SSR标记(2010对)加密原有的S94×S06(RIL群体)遗传图谱。新的S94×S06扩充图谱包含610个标记位点(384个SSRs,199个SRAPs,23个SCAR,1个STS和3个形态性状位点),覆盖基因组749.2cM,标记间平均间距1.2cM。对黄瓜的再生体系和转化体系进行了优化。MS+ 6-BA1.0mg/L+ABA1.5mg/L+AgNO32.0mg/L培养基可直接诱导子叶节产生丛生芽,最短45d可获得完整植株。转化体系部分,最佳的预培养时间1-2d,侵染时间20-30min,共培养3d,选择培养阶段kan50mg/L,抗氧化剂的加入可显著提高转化效率。以黄瓜无侧枝品系S61和419,有侧枝品系S06和SB-2为材料,遗传分析表明,侧枝表型(有侧枝:无侧枝)的分离情况符合由一对显/隐性基因控制的分离比率。将此基因命名为nlb(non-lateral-branch),并利用分离群体分组混合分析法(BSA)对该基因进行基因定位。筛选得到nlb 基因连锁标记9 个,通过F2 群体验证和MAPMAKER3.0 软件分析,nlb 基因定位于黄瓜1号染色体,其两侧最近的标记是SSR12258和SSR14596,图距分别为5.3cM和4.1cM。


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
  • 2
  • 0
  • 0
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