本研究以本课题组在国际上率先完成全基因组测序工作的志贺氏菌福氏2a 301株为模式,通过生物信息学分析与分子生物学实验相结合的手段,进行小RNA和小开放读码框的预测、筛选和鉴定工作。研究中首先在志贺菌中鉴定了64个在其他细菌中发现的小RNA,然后使用生物信息学预测、高密度全基因组芯片分析、RT-PCR和Northern杂交验证相结合的手段,发现9个小RNA,29个候选小开放读码框。本研究提出的方法可在任何一个已知序列的细菌中开展小RNA和小开放读码框预测研究。
英文主题词higella;small RNA;small ORF