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以志贺氏菌为模式探索发现、筛选和鉴定小RNA的整合技术
  • 项目名称:以志贺氏菌为模式探索发现、筛选和鉴定小RNA的整合技术
  • 项目类别:青年科学基金项目
  • 批准号:30700033
  • 申请代码:C010603
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2008-01-01-2010-12-31
  • 项目负责人:彭俊平
  • 负责人职称:副研究员
  • 依托单位:中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所
  • 批准年度:2007
中文摘要:

本研究以本课题组在国际上率先完成全基因组测序工作的志贺氏菌福氏2a 301株为模式,通过生物信息学分析与分子生物学实验相结合的手段,进行小RNA和小开放读码框的预测、筛选和鉴定工作。研究中首先在志贺菌中鉴定了64个在其他细菌中发现的小RNA,然后使用生物信息学预测、高密度全基因组芯片分析、RT-PCR和Northern杂交验证相结合的手段,发现9个小RNA,29个候选小开放读码框。本研究提出的方法可在任何一个已知序列的细菌中开展小RNA和小开放读码框预测研究。

结论摘要:

英文主题词higella;small RNA;small ORF


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
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