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钙离子调节蛋白机制的理论研究
  • 项目名称:钙离子调节蛋白机制的理论研究
  • 项目类别:青年科学基金项目
  • 批准号:20503002
  • 申请代码:B0302
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2006-01-01-2008-12-31
  • 项目负责人:谭宏伟
  • 负责人职称:副教授
  • 依托单位:北京师范大学
  • 批准年度:2005
中文摘要:

本项目结合量子化学方法和分子动力学方法对钙调素的离子选择性,钙调素的结构功能关系,以及钙调素和靶标多肽的结合性质进行了一系列的研究。主要的研究内容和所得结论包括以下四个方面第一,研究了Ca2+从CaM的C端球域离解的过程,给出了一个较为详细的连续的Ca2+离解机理。第二,模拟了CaMKI-CBD的从天然的无序态到和CaM结合后形成的有序态的构象转换过程;计算了CaM和不同状态下的CaMKI-CBD的结合自由能,以及CaM和一系列不同蛋白(包括smMLCK,CaMKIIa,CaMKK,CaV1.2,MARCKS)的CBD之间的结合自由能,阐明了非极性作用主导着CaM和众多CBD之间的相互作用,范德华作用驱动了诸多CBD的折叠过程,揭示了为什么CaM可以采用如此众多的形式来结合CBD。第三,通过对一种新颖的X型CaM双聚体与其靶蛋白(Calcinerun, Cn)的CBD结合模式的研究,发现了CnA-CBD在稳定X型CaM双聚体时发挥了很重要的作用。最后,我们研究了钙调素的EF-hand结构对不同离子的结合选择性,阐明了钙调素对钙离子具有特别的生理选择性的原因。

结论摘要:

英文主题词calmodulin;Ef-hand;molecular dynamics,protein-protein interaction


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
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