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深海宏基因组文库中潜在抗生素生物合成基因簇的发现及其在链霉菌中的表达
  • 项目名称:深海宏基因组文库中潜在抗生素生物合成基因簇的发现及其在链霉菌中的表达
  • 项目类别:青年科学基金项目
  • 批准号:40606031
  • 申请代码:D0609
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2007-01-01-2009-12-31
  • 项目负责人:徐俊
  • 负责人职称:研究员
  • 依托单位:上海交通大学
  • 批准年度:2006
中文摘要:

深海是地球上最大的极端生命环境,其中蕴藏着丰富的微生物资源。以针对聚酮合酶(PKS)基因保守区的简并引物,通过PCR扩增从东太平洋深海沉积物宏基因组文库ES0303中筛选获得了一个携带潜在抗生素生物合成基因簇的黏粒20G5。对该黏粒的序列分析结果表明其31kb连续的PKS/NRPS基因簇与海绵共生细菌中负责onnamides生物合成的PKS基因的蛋白序列相似性达50%左右,其NRPS基因簇与Myxococcus xanthus 肠杆菌素NRPS基因的蛋白序列相似性达到41%,暗示该基因簇可能编码pederin家族类抗生素。通过PCR-targeting技术对该黏粒进行改造后导入链霉菌宿主,获得了该基因簇整合于宿主染色体上的接合转移子,并对其发酵产物进行了初步研究。亚克隆了该基因簇中NRPS部分的第一个腺苷酰化酶基因,在大肠杆菌宿主中进行异源表达,获得可溶性的蛋白。此外,还从上述宏基因组文库ES0303中筛选获得了两个携带潜在卤代酶基因的黏粒2B3和16G8。对 2B3上的一个卤代酶进行异源表达后,可以检测到色氨酸的卤代产物,显示了利用该卤代酶组合生物合成新的"非天然天然产物"的潜力。

结论摘要:

英文主题词deep-sea metagenomic library,antibiotics, biosynthesis gene cluster, heterlogous expression


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
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