建立在自然杂交基础之上的植物进化和物种形成是一个相当复杂的过程。只有将当前发生的杂交过程与历史上的杂交事件相结合、并深入到分子水平上探察其中的复杂机理,才有可能完整我们的认识。眼子菜属(Potamogenton)杂交种比例高、种群分布具有典型的杂交带特征、属的大小适中,并拥有从二倍体到六倍体的较完整倍性系列,是研究自然杂交与进化关系的理想类群之一。本项目将以有关研究的最新发展动向为出发点,对该属的推定杂交物种进行遗传学认定,进而将以杂交带为模型的进化研究、杂交-多倍体-基因组进化的研究和种间网状进化关系的分子谱系分析相结合,系统深入地研究属内植物自然杂交的发生过程及其复杂进化机制。在阐明该属植物的杂交历史、高比例杂交种的发生原因和维持机制、同倍和多倍化物种起源的方式、杂交及多倍体形成后基因组的进化模式等问题的同时,为完善植物进化生物学的理论体系做出重要的贡献。