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东亚飞蝗AChE1的结构测定及其与特异性底物作用的分子基础
  • 项目名称:东亚飞蝗AChE1的结构测定及其与特异性底物作用的分子基础
  • 项目类别:青年科学基金项目
  • 批准号:31101447
  • 申请代码:C140205
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2012-01-01-2014-12-31
  • 项目负责人:周小霞
  • 依托单位:中国人民解放军第三军医大学
  • 批准年度:2011
中文摘要:

乙酰胆碱酯酶(Acetylcholinesterase,AChE)具有催化神经递质乙酰胆碱降解、保证神经信号正常传递的重要作用。研究表明,AChE1在许多昆虫体内主要发挥胆碱能作用,是有机磷及氨基甲酸酯类杀虫剂的作用靶标。但是,AChE1晶体结构至今仍不清楚,成为制约其构效关系研究和新型杀虫剂研发的瓶颈。本项目拟在前期克隆和表达重要农业害虫东亚飞蝗AChE1基础上,采用气相扩散法分别制备AChE1及其与底物类似物的晶体,收集晶体X射线衍射图谱,采用分子置换法构建晶体结构模型,明确AChE1活性中心、底物结合位点、疏水性结合区的空间结构;以AChE1-底物类似物晶体结构为基础,采用分子动力学方法模拟AChE1与特异性底物作用的动态过程,阐明AChE1对底物的选择机制。本研究不仅有助于阐明东亚飞蝗AChE1的结构功能关系,而且将为其他昆虫AChE1的功能研究以及新型杀虫剂的设计奠定坚实的基础。

结论摘要:

东亚飞蝗Ⅰ型乙酰胆碱酯酶(Loucusta migratoria manilensis Acetylcholinesterase 1, LmAChE1)在东亚飞蝗体内主要发挥胆碱能作用,是有机磷及氨基甲酸酯类杀虫剂的作用靶标。本项目拟在前期基因克隆、蛋白表达与酶学特性研究基础上,制备LmAChE1蛋白晶体,收集其X射线衍射图谱,解析其三维结构,阐明LmAChE1对底物的选择机制。一方面,我们在前期研究工作基础上,重新活化与诱导装载有LmAChE1基因的工程菌株,从菌液中纯化与浓缩目的蛋白,采用气相扩散法筛选与优化蛋白结晶条件。目前已将所得到的高纯浓缩蛋白用于结晶条件筛选与优化,获得了蛋白质结晶的基本条件,但晶体不够结实,仍需进一步优化结晶条件以获得质量更高的蛋白质晶体。另一方面,我们根据序列比对结果,采用同源模建法,选择人乙酰胆碱酯酶(PDB: 4ey4, 2.16?)为模板,构建了LmAChE1的三维结构,用Procheck、Verify_3D和QMEAN程序评估了模型的合理性;采用分子对接软件研究了底物类似物硫代乙酰胆碱(acetylthiocholine, ATC)、硫代丙酰胆碱(propionylthiocholine, PTC)、硫代丁酰胆碱(butyrylthiocholine, BTC)与LmAChE1的作用模式。结果表明(1)ATC、PTC、BTC的季胺阳离子均正对LmAChE1 Trp36的吲哚环,并与之产生cation-π相互作用;(2)ATC、PTC、BTC的硫酯基均位于LmAChE1 的Ser151和His391之间,且羰基氧与His391咪唑环N-H形成氢键;(3)ATC和PTC在LmAChE1催化腔中的构象较为舒展,而BTC的构象则稍显扭曲。在缺乏晶体结构时,尝试以同源性较高的蛋白质晶体结构为模板,用同源模建法构建出合理的蛋白质三维结构模型,进而研究该模型与底物类似物之间的相互作用,有助于从理论上预见底物在LmAChE1催化谷中的取向及其相互作用,初步揭示LmAChE1对底物的选择机制。当然,这些理论研究的结果仍需等到从实验中获得并解析出LmAChE1蛋白晶体结构时,才能得到检验或印证。


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
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