本项目在自行研制的AG-100型高通量DNA测序仪的基础上,提出了基于4荧光双碱基编码解码技术,发展了基于组合信号编码的循环连接DNA测序方法。研究证明,该方法可大幅度提高DNA测序的效率。利用AG-100系列高通量测序平台,开展了微生物基因组从头测序和拼接研究,完成了第一个中国人基因组(炎黄1号)的再测序,证实AG-100测序平台具有较强的测序和分析能力。开发了基于AG100系列DNA测序平台的生物信息学分析软件,实现了多平台间数据互通功能。应用高通量测序技术,获得大量的小RNA数据,结合miRNA的生物学特点,发展了一套系统实用的miRNA分析方法,研究miRNA分析策略及数据挖掘方法。发展了基于序列结构特征的宏基因组分析核心算法,开发了与AG系列高通量快速DNA测序系统无缝集成的基于"Browser-Server"结构的实用软件。
英文主题词new genration DNA sequencing, genome sequencing, miRNA, metagenomics, bioinformatics