位置:立项数据库 > 立项详情页
高通量DNA测序片段的拼接
  • 项目名称:高通量DNA测序片段的拼接
  • 项目类别:面上项目
  • 批准号:30871393
  • 申请代码:C060702
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2009-01-01-2011-12-31
  • 项目负责人:陆祖宏
  • 负责人职称:教授
  • 依托单位:东南大学
  • 批准年度:2008
中文摘要:

本项目在自行研制的AG-100型高通量DNA测序仪的基础上,提出了基于4荧光双碱基编码解码技术,发展了基于组合信号编码的循环连接DNA测序方法。研究证明,该方法可大幅度提高DNA测序的效率。利用AG-100系列高通量测序平台,开展了微生物基因组从头测序和拼接研究,完成了第一个中国人基因组(炎黄1号)的再测序,证实AG-100测序平台具有较强的测序和分析能力。开发了基于AG100系列DNA测序平台的生物信息学分析软件,实现了多平台间数据互通功能。应用高通量测序技术,获得大量的小RNA数据,结合miRNA的生物学特点,发展了一套系统实用的miRNA分析方法,研究miRNA分析策略及数据挖掘方法。发展了基于序列结构特征的宏基因组分析核心算法,开发了与AG系列高通量快速DNA测序系统无缝集成的基于"Browser-Server"结构的实用软件。

结论摘要:

英文主题词new genration DNA sequencing, genome sequencing, miRNA, metagenomics, bioinformatics


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
  • 26
  • 0
  • 0
  • 0
  • 0
期刊论文
相关项目
期刊论文 18 会议论文 3
期刊论文 55 会议论文 3 著作 1
陆祖宏的项目
期刊论文 110 会议论文 2 著作 4