钙黏附蛋白是介导细胞-细胞黏附的重要功能蛋白。本项目将发展基于全原子和粗粒化模型的多尺度建模和模拟方法,构建理论模型,研究黏附蛋白胞外功能域结构及其功能关系,主要研究内容包括(1)钙黏附蛋白胞外功能域自身的力学、动力学特性及其与细胞-细胞黏附的关系;(2)钙黏附蛋白胞外功能域形成cis/trans相互作用的动力学过程及其控制因素;(3)多个钙黏附蛋白共同作用,cis/trans作用构型间的协同行为,及其对细胞-细胞黏附区域形成、强度、稳定性等问题。研究的重点在于充分理解钙黏附蛋白胞外功能域自身的力学、动力学特性,相互作用形成的动力学过程及其影响因素,充分理解钙黏附蛋白胞外功能域结构、动力学特性对其功能表达以及对细胞-细胞黏附的影响。本项目不仅着眼于研究钙黏附蛋白系统本身,而且试图建立一系列模型和方法,使该模型和方法能够应用于类似的蛋白质系统,尤其是细胞黏附相关蛋白系统中。
英文主题词Biomolecular interaction;Cadherin;Single- molecule dynamic force spectroscopy;Molecular dynamics;