脂多糖结合蛋白(LPS binding protein, LBP)是病原菌引发脓毒症的关键效应分子之一。本课题在既往研究基础上,率先以整个基因为单位研究LBP基因所有单核苷酸多态性(SNP,n=51)与脓毒症风险性的内在联系。在LBP基因系统测序的基础上,结合HapMap数据库,首先构建中国汉族人LBP基因常见SNP位点连锁不平衡单倍域,并计算出每个单倍域内有代表性的标签SNP位点;利用高通量Pyrosequencing定量遗传分析系统和现有的严重创伤患者DNA标本库(n=500),观察常见标签SNP及其单倍型与创伤患者继发脓毒症风险性的关联性,进一步找出与脓毒症易患性有关的标签SNP及其单倍型;并在生物信息学分析的基础上利用ELISA、qPCR、报告基因,明确LBP基因内功能性SNP位点的意义。以期为危重病并发脓毒症的预警诊断和个体化治疗以及疾病遗传学研究提供新思路。
complications;sepsis;LBP;gene polymorphism;htSNP
本课题以LBP基因上下游10kb范围为整体,通过连锁不平衡分析,构建出7个连锁不平衡区域,并挑选出9个标签SNP位点。利用Pyrosequencing基因分型方法,观察重庆地区557例严重创伤患者中9个标签SNP位点的分布情况,筛选出脓毒症及多器官功能衰竭易感SNP位点rs2232618。其与脓毒症及多器官功能衰竭的关系进一步在230例浙江地区严重创伤患者中得到验证。携带26887C等位基因(436Leu)的严重创伤患者更易并发脓毒症及多器官功能衰竭等严重并发症。生物信息学分析发现rs2232618位点位于LBP与CD14结合的C末端,且位于蛋白活性中心内。通过系列体外实验,证实rs2232618(Phe436Leu)多态性位点能够通过影响LBP与CD14结合能力,使细胞结合更多LPS,从而激活效应细胞,增强机体炎症反应水平。研究发现了新的创伤后脓毒症易感性的生物标志——LBP rs2232618位点,并为危重病并发脓毒症的预警诊断和个体化治疗以及疾病遗传学研究提供新思路。