中文摘要：

株高是水稻最重要的农艺性状之一，受主基因或数量性状基因（QTL）控制。染色体片段置换系是QTL鉴定和精细定位的良好材料。申请人利用染色体片段置换系群体鉴定出1个控制水稻株高的基因Ph-6，位于水稻第6染色体长臂端，与RM528和RM340之间的距离分别为5.9cM和4.6cM。该项目（1）通过扩大作图群体和开发分子标记，将Ph-6精细定位，分析其可能的候选基因；（2）通过测序，寻找DNA序列的差异；利用RT-PCR和Northern Blot技术分析表达差异，明确目的基因；（3) 利用农杆菌介导转化法做转基因功能互补试验，结合RNAi干涉技术做进一步的功能验证。通过株高基因Ph-6的精细定位和克隆，为从分子水平上阐明水稻株高的遗传机制、水稻株型的分子设计育种及获得具有自主知识产权的水稻重要基因奠定良好的基础。

结论摘要：

株高是水稻最重要的农艺性状之一，受主基因或数量性状基因（QTL）控制。株高基因的鉴定、定位和克隆，在株型改良育种等方面具有非常重要的意义。以籼稻品种9311为轮回亲本，粳稻品种日本晴为供体构建染色体片段置换系群体，设计分子标记，对株高基因Ph-6进行了精细物理图定位。1、利用染色体片段置换系群体，构建了包括676株用于株高基因Ph-6定位的F2作图群体。设计SSR标记，对Ph-6基因初步遗传学定位。Ph-6被定位在分子标记RM528、RM3430和RM3188、RM340之间，与标记间的遗传距离分别为3.98cM、5.24cM、3.24cM和3.82cM；2、利用次级染色体片段置换系（编号643）和9311杂交，重新构建了5218株次级分离作图群体，筛选出1108个隐性单株。利用RM3430和RM340对隐性单株进行分子检测，获得交换单株103个；3、在RM3430和RM340之间设计22对SSR和INDEL引物，筛选到6对双亲间具有多态性的标记，通过对103个交换株进行分子检测，结合交换株表型，将Ph-6界定在INEDL2和INDEL5之间约36.647kb的物理距离内。INDEL2与Ph-6与共分离，INDEL5与Ph-6有1个基因型交换；4、在INDEL2和INDEL5间设计SNP标记和缺失多态性标记，通过分子检测，INDEL2与Ph-6与共分离，SNP-4与Ph-6有1个基因型交换，最终将Ph-6界定在INDEL2和SNP-4之间约18.603kb的物理距离内。利用基因预测软件，在Ph-6所在的物理范围内共预测到1个开放阅读框；5、通过对次级分离群体高秆植株和矮秆植株的各节间长度测定，最终明确突变体株高表型的增加主要与水稻第二节间的伸长显著相关。6、在该课题支持下，共发表研究论文7篇。其中，SCI论文1篇、国家级学报2篇、中文核心期刊4篇。