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5q22.1区域搜寻特应性皮炎易感基因研究
  • 项目名称:5q22.1区域搜寻特应性皮炎易感基因研究
  • 项目类别:面上项目
  • 批准号:81172838
  • 申请代码:H1007
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2012-01-01-2015-12-31
  • 项目负责人:肖风丽
  • 负责人职称:教授
  • 依托单位:安徽医科大学
  • 批准年度:2011
中文摘要:

特应性皮炎是一种常见的慢性复发性、瘙痒性、炎症性皮肤病。本病具体发病机制尚不明确,可能是由遗传和环境因素共同作用所致。近期本课题组对1012患者和1362对照进行全基因组关联研究,并将其初步结果在两个独立人群中进行验证,发现一个新的易感位点5q22.1上约有600kb长度区域与特应性皮炎易感性显著相关(P=3.15×10-9)。为明确该区域的特应性皮炎易感基因,本研究拟联合应用Sequenom、Taqman基因分型技术和ABI3730测序技术对5q22.1区域进行精细定位和易感基因搜寻,结合临床信息构建基因型-表型及风险单倍型数据库。并对易感基因进行mRNA表达、蛋白表达水平及细胞分子水平等功能学研究,最终确定特应性皮炎的易感基因。本项目将为特应性皮炎的分子遗传学发病机制提供新的理论依据,有望从分子遗传学水平揭示特应性皮炎新的生物学机制,对发现易感人群、早期预防及进行有效的治疗具有重意义。

结论摘要:

特应性皮炎(atopic dermatitis, AD)是一种伴有剧烈瘙痒的慢性复发性皮炎为特点炎症性皮肤病。本病原因不明,是由遗传因素与环境共同作用的一种复杂疾病。2011年我们对中国汉族人1012例AD和1119例对照进行全基因组关联分析(GWAS),发现5q22.1区域与AD易感性显著相关,通过对区间内基因功能分析及生物信息学预测,考虑TMEM232/SLC25A46为中国汉族人群AD的易感基因。为明确5q22.1区域AD易感基因, 利用前期GWAS数据,对该区域进行了Imputation分析,发现了3,382个SNP点和188个缺失插入突变(insert/deletion, indel),将P<0.01,MAF>0.05 的10个indels和前期GWAS研究发现的4个SNP,利用Sequenom平台在3,013 AD患者和5,075 对照人群中进行验证。显示3个indel变异与AD显著相关,将验证后的indel 和SNP变异做逐步条件回归分析,发现缺失变异rs11357450为该区域最强作用信号。生物信息学分析显示,rs11357450位于TMEM232内含子上,与H3K4Me1组蛋白修饰信号和转录因子结合位点变化相关。为明确该基因在皮损中表达情况,进行了TMEM232的免疫组化研究,发现TMEM232在正常人群和AD患者皮肤的表皮、皮脂腺和汗腺均有表达。在AD患者组织表皮中染色强度从颗粒层向基底层逐渐减弱,而在正常表皮组织中,染色强度变化相反。AD患者组织的血管周围淋巴细胞亦有TMEM232表达。通过上述研究明确了5q22.1区域上的TMEM232基因为AD的易感基因,为进一步理解AD发病机制提供新的理论依据。本项目组同时开展AD其它遗传相关研究,包括欧洲及日本人群GWAS新发现的易感基因位点,变应致敏相关易感位点,PRKAG2基因多态性与汉族人AD的相关性研究,中国汉族特应性皮炎患者过敏史相关性分析,均取得了有意义的结果。积极开展国际合作研究,作为主要成员单位,参加了“早期遗传学生命历程流行病学(鹰)学会(EAGLE)”发起的,全球共有16个国家的26个研究团队参加的AD易感基因研究国际合作项目,相关研究成果文章发表《自然遗传》杂志上。本项目组发表 4篇SCI论文,8篇中文论文包括1篇中文论著,4篇综述,3篇病例报道。


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
  • 24
  • 0
  • 0
  • 0
  • 0
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