建立3千个天然小分子的3D结构库;建立组织蛋白酶K的虚拟筛选模型[hCAT-K(vs)];在组织蛋白酶B和K虚拟筛选模型[hCAT-B(vs)、hCAT-K(vs)]上开展虚拟活性筛选,累计筛选6千个天然小分子;对打分较高的化合物结合3D-QSAR模型分析,理论预测活性化合物,即组织蛋白酶B和K的抑制剂;如果虚拟活性筛选发现的活性化合物能获得,再在我们已有的体外组织蛋白酶B和K筛选模型(hCAT-
组织蛋白酶是一类重要的胞内蛋白酶,其中组织蛋白酶B和K分别是重要的抗肿瘤转移和抗骨质疏松的药靶;植物环肽是一类重要的植物次生代谢产物,其功能研究不多。本项目为小额资助,在对研究计划作适当调整后超额完成了任务,并取得了较好的成绩。在建立新的天然小分子数据库的基础上,结合已有生物活性筛选的实验结果,开展了相关重要药靶抑制剂的对接、3D-QSAR和虚拟筛选研究,即建立了已发现的近500个天然植物环肽分子的3D结构库;建立了较好的组织蛋白酶B的虚拟筛选模型,应用Dock4.0、Cscore和FlexX在Specs数据库中开展了24万个分子的虚拟筛选,发现了132个潜在的抑制剂;应用Sybyl6.9、GOLD2.2、FlexX、MVD2006、CoMFA和CoSIA开展了206个组织蛋白酶B双黄酮类、组织蛋白酶K肽醛类和肽酮类、碳酸酐酶II磺酰胺类和基质金属蛋白酶9黄酮类抑制剂的3D-QSAR和对接研究。发表10篇论文,SCI论文5篇;培养4名博士生。这些研究搭建了较好的药物设计平台,为这些蛋白酶抑制剂的设计及其先导化合物和新药的发现提供了重要方向,为后续植物环肽开展虚拟活性筛选奠定了良好基础。