利用小RNA介导的RNA沉默获得抗病毒作物,而不是用大片段的病毒基因序列,能消除人们对携带病毒基因的转基因作物安全性的顾虑;而选择有效的小RNA靶点以高效沉默病毒靶标,是前沿理论产业化的充分体现。植物中利用小RNA靶向病毒基因来获得抗病作物的研究刚刚起步,而在小RNA靶点选择这一关键环节存在较大的盲目性。本项目以黄瓜花叶病毒CMV为对象,进行病毒基因组有效小RNA靶点遴选的研究。以多分体基因组CMV的3'UTR区为靶向目标序列,利用该序列具有功能的保守二级结构的特点,寻找siRNA-RISC复合物的有效进入点。力求能够在3'UTR这一保守结构中,既获得最有效的siRNA-RISC的作用靶点,又能避免病毒由于在寄主体内的抗性选择压力下,因非保守区的高突变率而产生耐抗性突变株,使植物的抗性失去持久性。借助这一方法,使小RNA介导的抗病理念在植物抗病中得到真实体现;并为作物抗病分子设计做出贡献。