从分子水平探讨我国儿科结核分支杆菌的耐药性及耐药机制,建立TaqMan聚合酶链反应的快速基因诊断方法。采用国际标准化的IS6110-RFLP的DNA多态性指纹图技术,在国内建立儿科结核分支杆菌耐药的分子流行病学工作网,阐明儿科耐药及多重耐药结核分支杆菌的基因特征,及早发现和预报耐药新克隆流行,监测新耐药克隆株的来源和发展规律;应用PCR-SSCP法、RT-PCR法、Northern-blottin
本研究选取121株北京地区结核分枝杆菌进行基因分型和耐药相关基因突变检测。Spoligotyping分型发现北京基因型占91.7%;选72株北京基因型菌株进一步采用MLVA和IS6110-RFLP分型,发现不同VNTR组合(12位点,15位点,24位点)的分辨指数分别为0.788,0.990,0.992,后两个组合的差异是由位点Mtub 29引起的;IS6110-RFLP的分辨力最高,达0.999;采用改进的RIFO杂交检测发现91.5%的利福平耐药株和92.9%的耐多药菌株存在rpoB基因核心区突变;PCR-RFLP和反向线性杂交结果显示异烟肼耐药株中katG突变率为60.6%,inhA突变率为15.2%;碱基特异性多重PCR检测结果与PCR-RFLP和RLB分别检测的结果一致。综上所述,北京基因型是北京地区的主要流行基因型;VNTR 15位点与Mtub 29组合可作为北京地区MTB分子流行病学研究的一线方法;rpoB基因核心区可作为RIF耐药和耐多药检测的分子标志;同时检测katG和inhA基因可提高INH耐药株的检出率;改进的RIFO杂交和碱基特异性多重PCR具有临床应用价值。