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人ACER2基因启动子的鉴定与初步分析
  • ISSN号:1674-7666
  • 期刊名称:中国细胞生物学学报
  • 时间:2011
  • 页码:674-680
  • 分类:Q754[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]重庆医科大学生物化学与分子生物学教研室,重厌400016, [2]重庆医科大学分子二医学与肿瘤研究中心,重庆400016
  • 相关基金:国家自然科学基金(No.30801356,No.81001097)、重庆市科委自然科学基金(No.2010BB5357)和重庆巾教委科学技术研究(No.KJ0903051资助项目
  • 相关项目:“Plk1基因启动子自驱动Plk1siRNA表达”新策略应用于食管癌靶向治疗的研究
中文摘要:

碱性神经酰胺酶2(alkaline ceramidase2,ACER2)是一个参与脂质类信号分子神经酰胺代谢的酶分子,在细胞增殖、衰老和凋亡等过程中起重要作用。为了进一步研究ACER2基因的转录调控机制,该研究克隆鉴定了ACER2基因的启动子。首先,应用5’RACE(rapid amplification of cDNAends,cDNA末端快速扩增)技术鉴定了ACER2基因的转录起始位点。然后,通过PCR定向克隆和定点突变策略,构建了三个长度不同的覆盖ACER2基因5’端侧翼区起始密码子ATG上游约1-3Kb区域的一系列ACER2基因启动子荧光素酶报告基因重组体。启动子活性分析表明,ACER2基因启动子定位于转录起始位点附近约670bp的区域内。转录因子结合位点分析结果表明,ACER2基因启动子含有Spl、GATA-1和AP-1等潜在的转录因子结合位点,提示sp1和GATA-1等转录因子可能参与ACER2基因的转录调控。

英文摘要:

Alkaline ceramidase 2, ACER2, is a ceramide-hydrolyzing enzyme which plays an important role in cell proliferation, senescence, and apoptosis etc. To further investigate its transcriptional regulatory mechanism, ACER2 gene promoter has been cloned and identified in the present study. At first, the transcriptional start sites for ACER2 gene have been identified by 5' RACE (rapid amplification of cDNA ends) and bioinformatic analysis. Fur- thermore, three overlapping genomic fragments from the 5'-flanking region ofACER2 gene have been coloned into pGL3-basic vector to construct ACER2 promoter reporters. Luciferase reporter assay indicated that ACER2 pro-moter region is mainly located in a 670 bp region nearby the transcriptional start site. Transcriptional factor binding analysis indicated that, ACER2 gene promoter contains several putative binding sites for transcriptional factors such as Spl and GATA-1. These results suggested that transcriptional factors such as Spl and GATA-1 might be invovled in the transcriptional regualtion of ACER2 gene.

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期刊信息
  • 《中国细胞生物学学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:
  • 主办单位:中国细胞生物学学会 中国科学院上海生命科学研究院 生物化学与细胞生物学研究所
  • 主编:郭礼和
  • 地址:上海岳阳路319号31A楼303室
  • 邮编:200031
  • 邮箱:CJCB@SIBS.AC.CN
  • 电话:021-54920950 54922892
  • 国际标准刊号:ISSN:1674-7666
  • 国内统一刊号:ISSN:31-2035/Q
  • 邮发代号:4-296
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版)
  • 被引量:2456