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兼性无融合生殖龙须草SSR引物开发及杂交后代的检测
  • ISSN号:1000-4025
  • 期刊名称:西北植物学报
  • 时间:0
  • 页码:1947-1953
  • 语言:中文
  • 分类:Q789[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]华中农业大学园艺林学学院,武汉430070, [2]华中农业大学生命科学技术学院,武汉430070
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(30670127)
  • 相关项目:早花变异枳LFY基因的启动子结构及表达调控机制研究
中文摘要:

以来自中国5个省份12个居群的龙须草为材料,通过锚定PCR开发复合SSR引物、数据库检索和近缘物种SSR引物的引用等3种方法开发龙须草的SSR引物。结果显示:在锚定PCR开发复合SSR位点所设计的33对引物中筛选到有效扩增引物13对,表现多态性的引物有6对;利用基因特异序列法得到多态性引物3个;所用18条同源物种引物中有83%的SSR引物在供试的12个龙须草居群中都有清晰的SSR条带,其中56%的引物表现出多态性。3种方法在龙须草12个居群中共筛选得到了19对多态性引物,多态性比率约为73%。利用筛选得到的SSR多态性引物对来自2个居群的杂交F1代进行检测,鉴别出只有母本带型的无融合生殖后代和具有双亲带型的杂交后代,在子代中还出现偏父本带型、亲本缺失带型和变异带型等,证明所开发的SSR引物可以揭示龙须草生殖方式的复杂性,适用于龙须草遗传分析及亲缘关系鉴定。

英文摘要:

Eulaliopsis binata is a facultative apomictic resource in Poaceae. Three methods, anchored PCR amplification of compound SSRs,datebase-searching and transferability of SSRs from related species, were used to isolate microsatellites in the 12 populations of Eulaliopsis binata from 5 provinces in China. 33 primer pairs were designed by anchor-PCR amplification of compound SSRs,of which 13 primer pairs could get efficiency bands,and finally 6 primer pairs of these were polymorphic ones. 3 polymorphic primer pairs were developed based on datebase-searching. In addition, 18 primer pairs were selected from the relative species to analyze. It showed that of 83% primer pairs had product in 12 populations,and 56% primer pairs presented polymorphism. As results, 19 polymorphic primer pairs were obtained by three different development methods. To prove the applicability of these SSR primers, F1 progeny plants from two populations were analyzed. Besides apomictic and sexual progenies,there were offspring plants whose bands toward the paternal's , deficiency to parents and variation with parents.

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期刊信息
  • 《西北植物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:西北农林科技大学 陕西省植物学会
  • 主编:赵忠
  • 地址:陕西杨陵邰城路3号西北农林科技大学
  • 邮编:712100
  • 邮箱:xbzwxb@vip.163.com
  • 电话:029-87082936
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-4025
  • 国内统一刊号:ISSN:61-1091/Q
  • 邮发代号:52-73
  • 获奖情况:
  • 全国优秀期刊,中国自然科学核心期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:46104