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不同动物种源肺炎克雷伯氏菌分离株23SrRNA序列分析
  • ISSN号:1008-0589
  • 期刊名称:《中国预防兽医学报》
  • 时间:0
  • 分类:S852.61[农业科学—基础兽医学;农业科学—兽医学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]山东农业大学动物科技学院山东省动物生物技术与疫病防治重点实验室,山东泰安271018
  • 相关基金:国家自然科学基金(30972183)
中文摘要:

为分析动物种源肺炎克雷伯氏菌分离株(K.p妇)的进化特点,本研究通过PCR扩增不同动物种源K.pn的23SrRNA基因片段,克隆测序,进行BLAST比对;构建K-pm菌株的系统进化树。结果显示,本实验室保存的12株K.p力核苷酸序列与GenBank收录的X87284株K-pm核苷酸序列同源性为96.8%~99.0%,而与沙门氏菌和奇异变形杆菌同源性只有90.0%~92.7%;8株毛皮动物K.加核苷酸序列同源性为98.1%~99.9%,与猪源、鸡源K.p力的核苷酸序列同源性分别为95.5%~98.1%、96.7%~97.9%;猪源与鸡源K.pn的核苷酸序列同源性为95.9%~97.4%。结果表明,不同动物种源K-pn23SrRNA基因序列同源性差异明显,具有种属的特异性,23SrRNA基因序列可以作为鉴定K-pm的一种快速、简便的方法。

英文摘要:

To assess the evolution of Klebsiella pneumoniae (K.pn) by 23S rRNA genes, the fragments of 23S rRNA genes were amplified by PCR from different K.pn strains in animal species and sequenced. The alignment analysis results showed that the homologies between twelve K.pn strains were 96.8%-99.0% with the reference strains available in GenBank, which were 90.8%-91.7% with Salmonella and Proteus mirabilis; Of which the homologies between eight fur animal K.pn strains were 98.1% -99.9%, 95.5%-98.1% with porcine K.pn strains, and 96.7%-97.9% with fowl K.pn strains. The homologies between porcine K.pn and fowl K.pn strains were 95.9%-97.4%. The different animal species K.pn strains had a certain degree of genetic difference. 23S rRNA sequence analyses might be a reliable and rapid way for identification of different animal species K.pn.

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期刊信息
  • 《中国预防兽医学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国农业部
  • 主办单位:中国农业科学院哈尔滨兽医研究所
  • 主编:步志高
  • 地址:哈尔滨市香坊区哈平路678号
  • 邮编:150001
  • 邮箱:zgyfsyxbhvri@163.com
  • 电话:0451-51051811 51051812
  • 国际标准刊号:ISSN:1008-0589
  • 国内统一刊号:ISSN:23-1417/S
  • 邮发代号:14-70
  • 获奖情况:
  • 全国农业优秀期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:12844