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禽波氏杆菌RAPD-PCR反应体系的建立与优化
  • ISSN号:0529-6005
  • 期刊名称:《中国兽医杂志》
  • 时间:0
  • 分类:S852.61[农业科学—基础兽医学;农业科学—兽医学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]山东农业大学动物科技学院,山东泰安271018
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31272595;30972183;30740077)
中文摘要:

随机扩增多态性DNA (RAPD)作为一种分子标记技术,可用于多种病原菌的基因分型.为建立适合禽波氏杆菌RAPD分析的扩增体系,本试验以禽波氏杆菌基因组DNA为模板,对20条随机引物进行了筛选,并对RAPD-PCR反应体系中的重要参数设置梯度进行单因素试验分析,以确定最佳反应条件.经大量重复试验筛选到6条随机引物,确定25 μL的反应体系中模板DNA的量为50 ng,随机引物浓度为0.2 μmol/L,dNTPs的量为0.2 mmol/L,Mg2+浓度为1 mmol/L,Taq酶为1U.该优化体系对22株禽波氏杆菌均能扩增出清晰稳定且多态性好的DNA指纹图谱,为后续的禽波氏杆菌RAPD基因分型奠定了良好的基础.

英文摘要:

As a molecular marker technique, random amplified polymorphie DNA (RAPD) can be used for the genotyping of a variety of pathogens. To establish a suitable RAPD reaction system for Bordetella avium, genomic DNAs of Bordetella avium were ex- tracted as templates and 20 random primers were screened. Several significant parameters of RAPD-PCR reaction system were stud- ied and optimized by setting gradient for single-factor analysis. Through a large number of repeated trials, 6 suitable random primers were found and a stable reaction system was established: 25 IxL reaction system containing 50 ng DNA template, 0.2 p.mol/L random primer, 0.2 mmol/L dNTPs, lmmol/L Mg^2+ and 1U Taq DNA polymerase. It can generate clear, steady and polymorphie DNA frag- ment patterns for 22 Bordetella avium isolates which laid a good foundation for the subsequent RAPD genotyping.

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期刊信息
  • 《中国兽医杂志》
  • 北大核心期刊(2014版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国畜牧兽医学会
  • 主编:张克家
  • 地址:北京市海淀区圆明园西路2号
  • 邮编:100193
  • 邮箱:vetzzhi@cau.edu.cn
  • 电话:010-62733040
  • 国际标准刊号:ISSN:0529-6005
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2471/S
  • 邮发代号:2-137
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:19671