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部分柿属植物TRAP标记反应体系的建立与引物筛选
  • ISSN号:1001-8581
  • 期刊名称:江西农业学报
  • 时间:2014.9.15
  • 页码:1-5
  • 分类:Q949.775.3[生物学—植物学]
  • 作者机构:[1]华中农业大学园艺植物生物学教育部重点实验室,湖北武汉430070, [2]农业部热带果树生物学重点实验室/中国热带农业科学院南亚热带作物研究所,广东湛江524091
  • 相关基金:国家自然科学基金(31171929); 公益性行业(农业)科研专项(201203047)
  • 相关项目:与中国甜柿单宁凝固有关的两个功能基因及其育种应用研究
中文摘要:

为了建立柿属植物目标区域扩增多态性(TRAP)标记技术体系,对影响TRAP-PCR的Mg^2+、dNTPs、Taq DNA聚合酶、固定引物和随机引物浓度比5个因素进行了优化。确定优化的反应体系为:模板DNA 40 ng,buffer 1×,Mg^2+1.4 mmol/L,dNTPs 0.2 mmol/L,固定引物和随机引物浓度比为11∶1,Taq酶0.5 U,反应总体积为15μL。利用柿属植物EST数据库信息设计锚定引物10条,与11条随机引物组合共110对引物。利用这些引物对柿属植物6个基因型进行TRAP-PCR扩增,其中84个引物组合能扩增出清晰条带,占引物总量的76.36%;36个引物组合表现出良好的多态性扩增,并在20份柿属植物中进行了引物验证。

英文摘要:

The concentrations of Mg^2 +,dNTPs,Taq DNA polymerase and primers which affected TRAP( target region amplified polymorphism)- PCR reaction were optimized for the establishment of TRAP molecular marker system in Diospyros spp. The optimum reaction system was acquired as follows: template DNA 40 ng,buffer 1 ×,Mg^2 +1. 4 mmol /L,dNTPs 0. 2 mmol /L,fixed primer- arbitrary primer concentration ratio 11∶ 1,Taq DNA polymerase 0. 5 U,and total volume of reaction system 15 μL. Eighty- four TRAP primer combinations which showed robust PCR amplification in 6 persimmon genotypes were screened out from 110 primer combinations( 10 fixed primers times 11 arbitrary primers). Thirty- six polymorphic primer combinations were verified in 20 persimmon genotypes.

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期刊信息
  • 《江西农业学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:江西省农业科学院
  • 主办单位:江西省农业科学院 江西省农学会
  • 主编:马岩波
  • 地址:江西省南昌市南莲路602号农业科学院
  • 邮编:330200
  • 邮箱:jxny@163.com
  • 电话:0791-87090630 87090763
  • 国际标准刊号:ISSN:1001-8581
  • 国内统一刊号:ISSN:36-1124/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 江西省优秀期刊,全国优秀农业期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,中国中国科技核心期刊
  • 被引量:24809