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柿EST-SSR标记在柿属植物中的通用性研究
  • ISSN号:0439-8114
  • 期刊名称:湖北农业科学
  • 时间:2014.11.20
  • 页码:5434-5437+5462
  • 分类:Q949.775.3[生物学—植物学] Q943.2[生物学—植物学]
  • 作者机构:[1]华中农业大学园艺林学学院/园艺植物生物学教育部重点实验室,武汉430070, [2]中国热带农业科学院南亚热带作物研究所/农业部热带果树生物学重点实验室,广东湛江524091
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31171929); 公益性行业(农业)科研专项(201203047)
  • 相关项目:与中国甜柿单宁凝固有关的两个功能基因及其育种应用研究
中文摘要:

公共数据库和柿转录组测序产生的大量EST序列为开发新的SSR标记提供了有效资源。我们在前期利用这些数据开发出112个EST-SSR标记,此次研究选用其中11个标记对柿属(Diospyros L.)15个种20份试材进行了标记通用性检测。结果表明,所有引物均能扩增出产物,多态性引物比率达100%,并且UPGMA聚类结果可靠,说明柿EST-SSR标记在近缘种中可以通用。上述通用性标记为柿属植物遗传多样性研究提供了标记资源。

英文摘要:

The data of transcriptomic sequencing and growing availability of EST(Expressed sequence tag) sequences from Diospyros kaki Thunb. provide a potential valuable source of new SSR(Simple sequence repeats) markers. One hundred and twelve EST-SSR markers were developed explored in previous studies and eleven markers were used to amplify 20 genotypes of 15 species of Diospyros L. to assess the transferability and polymorphism. The results showed that all primers amplified successfully with the rate of polymorphic primer of 100% indicating that the EST-SSR markers developed from D. kaki could be applied in its related species. These transferable markers are useful for analyzing genetic diversity of Diospyros.

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期刊信息
  • 《湖北农业科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:湖北省农业科学院
  • 主办单位:湖北省农业科学院 华中农业大学 长江大学
  • 主编:焦春海
  • 地址:武汉市武昌南湖瑶苑1号省农业科学院内
  • 邮编:430064
  • 邮箱:hbnykxxzz@126.com
  • 电话:027-87389334
  • 国际标准刊号:ISSN:0439-8114
  • 国内统一刊号:ISSN:42-1255/S
  • 邮发代号:38-21
  • 获奖情况:
  • 国家期刊奖,全国农业核心期刊,湖北省优秀期刊,中国期刊方阵“双高”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:30537