位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
羽衣甘蓝SRAP体系建立与优化
  • ISSN号:1001-0009
  • 期刊名称:北方园艺
  • 时间:2014.5.15
  • 页码:121-124
  • 分类:S635[农业科学—蔬菜学;农业科学—园艺学]
  • 作者机构:[1]沈阳农业大学林学院,辽宁沈阳110866, [2]辽宁城市建设职业技术学院,辽宁沈阳110122
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(31101566).
  • 相关项目:羽衣甘蓝粉色叶基因定位及相关性状QTLs分析
中文摘要:

以羽衣甘蓝基因组DNA为模板,对相关序列扩增多态性聚合酶链式反应(SRAP—PCR)体系的各影响因子进行了单因素梯度设置,并优化了反应程序,筛选和建立了可扩增多态性高、重复性好、带型清晰的最佳SRAP反应体系和程序。结果表明:羽衣甘蓝最佳SRAP—PCR反应体系总体积10“L,包含DNA模板50ng,1×buffer,dNTPS0.20mmol/L,Taq酶1U,引物各0.60μmol/L。羽衣甘蓝最佳SRAP-PCR反应程序为94℃预变性5min,94℃变性30S,35℃退火30S,72℃延伸30S,5个循环;94℃变性30S,50℃退火30s,72℃延伸30S,35个循环;72℃终延伸7rnin,4℃保存。经22个羽衣甘蓝F2群体单株对上述优化的反应体系和程序进行验证,均获得了多态性丰富、条带清晰的扩增图谱,表明该程序和体系能很好地满足羽衣甘蓝基因组SRAP扩增要求。

英文摘要:

Taking the genomic DNA extracted from kale leaves as template, each influencing factor of amplified polymorphism polymerase chain reaction (SRAP-PCR) related to the sequence was set by the single factor gradient and the program was optimized, the SRAP which were high polymorphism, good repeatability, clear were screened. The results showed that the optimized protocol was as follows:a total volume of 10μL containing 50 ng genomic DNA, 1 X buffer, 0. 20 mmol/L dNTPs, 1 U of Taq DNA polymerase and 0. 60 μmol/L primers. Protocol run under the following conditions:predenaturing at 94℃ for 5 rain,then denatured at 94℃ for 30 s,annealed at 35℃ for 30 s,and an extension at 72℃ for 30 s for 5 times,denatured at 94℃ for 30 s and annealed at 50℃ for 30 s,and an extension at 72℃ for 30 s for 35 times,extension at 72℃ for 7 min at last, then kept at 4℃. The above optimal SRAP-PCR reaction system and amplification procedure were checked by 22 of F2 individuals. The system and procedure could be used in genomic DNA SRAP-PCR amplification in kale.

同期刊论文项目
期刊论文 7 会议论文 1 著作 1
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《北方园艺》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:黑龙江省农科院
  • 主办单位:黑龙江省园艺学会 黑龙江省农业科学院
  • 主编:毕洪文
  • 地址:哈尔滨市南岗区学府路368号
  • 邮编:150086
  • 邮箱:bfyybjb@163.com
  • 电话:0451-86674276
  • 国际标准刊号:ISSN:1001-0009
  • 国内统一刊号:ISSN:23-1247/S
  • 邮发代号:14-150
  • 获奖情况:
  • 1996年获黑龙江省优秀期刊奖(二等),2000年获黑龙江省优秀期刊奖,2002年获全国优秀农业期刊奖,2005年获首届黑龙江省出版精品工程提名奖,2009年获中国北方优秀期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:36972