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被子植物DNA去甲基化酶基因的进化分析.
  • ISSN号:0253-9772
  • 期刊名称:《遗传》
  • 时间:0
  • 分类:Q943[生物学—植物学]
  • 作者机构:[1]浙江大学农业与生物技术学院,杭州310058
  • 相关基金:国家重点基础研究发展计划(973计划)项目(编号:2010CBl26205),国家自然科学基金项目(编号:31171165)和人事厅留学回国基金项目(编号:J20120581)资助
中文摘要:

DNA甲基化模式和水平取决于DNA甲基转移酶和去甲基化酶的作用,而DNA去甲基化酶在DNA主动去甲基化过程中起到关键作用。文章以已知的10个DNA去甲基化酶基因为参照,鉴定出两种单子叶植物(水稻和高粱)、两种双子叶植物(拟南芥和毛果杨)中所有的DNA去甲基化酶同源基因,其中新鉴定出两类DNA去甲基化酶类似基因DML4和DML5。基于保守的糖苷酶结构域序列的系统进化分析以及基因在染色体上的位置分析表明,植物中DNA去甲基化酶基因存在串联复制、染色体区段复制和全基因组复制而导致基因的新功能化和亚功能化。文章还进一步分析了DNA去甲基化酶基因在不同组织中的表达情况,旨在理解DNA去甲基化酶基因的功能与进化的关系,以期为DNA去甲基化酶基因在植物中的利用提供参考。

英文摘要:

The DNA methylation patterns and levels are depended on the function of DNA methyltransferase and DNA demethylase, and DNA demethylase plays a critical role in active DNA demethylation. In this paper, all homologous DNA demethylase gene copies were identified in monocots (O. sativa and S. bicolor) and dicotyledon (A.thaliana and P trichocarpa) based on ten known DNA demethylase genes from rice and Arabidopsis. Two types of new DNA demethylase-like genes (DML4 and DML5) were identified. Tandem duplication, segmental duplication and whole genome duplication exist in DNA demethylase gene family in plants, which result in neo izatin and subfuncfionalization upon the phylogeny of conserved glycosylase domains and chromosomal locations of genes. Furthermore, the expression of DNA demethylase genes was investigated in different tissues. This study will facilitate our understanding of the relationship between function and evolution of DNA demethylase, and utilizing the DNA demethylase genes in plants.

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期刊信息
  • 《遗传》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国遗传学会
  • 主编:张永清
  • 地址:北京朝阳区北辰西路1号院中国科学院遗传发育所
  • 邮编:100101
  • 邮箱:yczz@genetics.ac.cn
  • 电话:010-64807669
  • 国际标准刊号:ISSN:0253-9772
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1913/R
  • 邮发代号:2-810
  • 获奖情况:
  • 中国自然科学核心期刊,《CAJ-CD》执行优秀奖,2008年12月获“中国精品科技期刊”证书和北京市印...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:23270