海草是世界上最重要的初级生产者之一,也是海洋生态系统食物链中的重要一环,海草床具有非常复杂的群落结构,它为一些幼鱼和贝类提供重要栖息地及隐蔽保护场所,也为一些植食性鱼类、某些水鸟和一些大型动物如海龟(Chelonia myalas)、儒艮(Dugong dugon)等提供觅食场所。同时,海草床还可以调节水体中的悬浮物、溶解氧、叶绿素、重金属和营养盐,减缓水流速度,对浅水水质的净化与底质的巩固发挥着关键作用。