位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
江西7种蛇类基于16S rRNA基因的DNA条形码构建
  • ISSN号:1006-0464
  • 期刊名称:《南昌大学学报:理科版》
  • 时间:0
  • 分类:Q959.6[生物学—动物学]
  • 作者机构:[1]南昌大学医学实验教学部,江西南昌330006, [2]南昌大学基础医学院,江西南昌330006, [3]南昌大学第一临床医学院,江西南昌330006, [4]中国科学院北京基因组研究所,北京100029
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(30871348); 南昌大学科研基金资助项目(Z04812);南昌大学大学生创新性实验计划项目(2010)
中文摘要:

采用新设计COI、16S、CR3种线粒体基因(位点)的简并引物,对江西地区常见蛇类(2科6属7种)共20个个体样本进行了DNA条形码分析的初步尝试,将实验结果结合GenBank部分蛇类序列数据分析表明,在本实验涉及的蛇类个体及类群的识别上,16S rRNA基因片段合乎通用条码标记的序列的要求;且本实验设计的16S简并引物有适用性强、宽容度大的优势。其次,本研究结果支持"16S rRNA基因至少应该作为脊椎动物标准条码标记———线粒体COI基因不可缺少的补充"观点;提示当前对DNA条形码在不同生物类群的应用方面,尚待在更大的标本样品数量及更多不同基因片段序列数据的支撑。

英文摘要:

Referred to snake sequence data from GenBank,and studied 20 samples of snakes in Nanchang,which include 2 families,6 genus,and 7 species,to present a first attempt in applying the usage of DNA barcode in the species of snakes.Our experiment demonstrates,in terms of identifying snakes samples or groups,mitochondrial 16S rRNA gene fulfills the requirements for a universal DNA barcoding marker;we also show certain advantage in the application and universality of combination.Furthermore,our result supports the opinion:"We strongly advocate the use of 16S rRNA as standard DNA barcoding marker for vertebrates to complement COI,especially if samples a priori could belong to various phylogenetically distant taxa and false negatives would constitute a major problem."(Miguel et a1.2005).we recommend richer species samples and larger various gene sequences to support a wider application of DNA barcode in different biological field.

同期刊论文项目
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《南昌大学学报:理科版》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:南昌大学
  • 主办单位:南昌大学
  • 主编:谢明勇
  • 地址:南昌市南京东路235号南昌大学期刊社
  • 邮编:330047
  • 邮箱:NCDL@chinajournal.net.cn
  • 电话:0791-88305805
  • 国际标准刊号:ISSN:1006-0464
  • 国内统一刊号:ISSN:36-1193/N
  • 邮发代号:44-19
  • 获奖情况:
  • 2004年国家教育部优秀科技期刊,2006年首届中国高校特色科技期刊,2009年第四届华东地区优秀期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,德国数学文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:5092